Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRTAP1-3Q8IUG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRTAP1-3Q8IUG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRTAP1-3Q8IUG1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRTAP1-3Q8IUG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRTAP1-3Q8IUG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRTAP1-3Q8IUG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRTAP1-3Q8IUG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRTAP1-3Q8IUG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRTAP1-3Q8IUG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRTAP1-3Q8IUG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRTAP1-3Q8IUG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRTAP1-3Q8IUG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRTAP1-3Q8IUG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRTAP1-3Q8IUG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRTAP1-3Q8IUG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRTAP1-3Q8IUG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRTAP1-3Q8IUG1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRTAP1-3Q8IUG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRTAP1-3Q8IUG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRTAP1-3Q8IUG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRTAP1-3Q8IUG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRTAP1-3Q8IUG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRTAP1-3Q8IUG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRTAP1-3Q8IUG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRTAP1-3Q8IUG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRTAP1-3Q8IUG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTAP1-3Q8IUG1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRTAP1-3Q8IUG1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRTAP1-3Q8IUG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRTAP1-3Q8IUG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRTAP1-3Q8IUG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRTAP1-3Q8IUG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRTAP1-3Q8IUG1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRTAP1-3Q8IUG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRTAP1-3Q8IUG1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRTAP1-3Q8IUG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRTAP1-3Q8IUG1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRTAP1-3Q8IUG1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRTAP1-3Q8IUG1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRTAP1-3Q8IUG1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRTAP1-3Q8IUG1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRTAP1-3Q8IUG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRTAP1-3Q8IUG1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRTAP1-3Q8IUG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRTAP1-3Q8IUG1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRTAP1-3Q8IUG1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRTAP1-3Q8IUG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRTAP1-3Q8IUG1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRTAP1-3Q8IUG1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRTAP1-3Q8IUG1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRTAP1-3Q8IUG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRTAP1-3Q8IUG1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRTAP1-3Q8IUG1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRTAP1-3Q8IUG1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRTAP1-3Q8IUG1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRTAP1-3Q8IUG1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRTAP1-3Q8IUG1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRTAP1-3Q8IUG1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRTAP1-3Q8IUG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRTAP1-3Q8IUG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRTAP1-3Q8IUG1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRTAP1-3Q8IUG1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRTAP1-3Q8IUG1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms