Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHISA2Q6UWI4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHISA2Q6UWI4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA2Q6UWI4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA2Q6UWI4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA2Q6UWI4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA2Q6UWI4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA2Q6UWI4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA2Q6UWI4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA2Q6UWI4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA2Q6UWI4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA2Q6UWI4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA2Q6UWI4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA2Q6UWI4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHISA2Q6UWI4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SHISA2Q6UWI4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHISA2Q6UWI4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA2Q6UWI4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHISA2Q6UWI4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA2Q6UWI4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA2Q6UWI4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA2Q6UWI4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA2Q6UWI4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHISA2Q6UWI4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SHISA2Q6UWI4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SHISA2Q6UWI4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHISA2Q6UWI4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA2Q6UWI4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA2Q6UWI4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA2Q6UWI4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHISA2Q6UWI4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHISA2Q6UWI4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA2Q6UWI4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA2Q6UWI4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA2Q6UWI4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA2Q6UWI4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHISA2Q6UWI4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SHISA2Q6UWI4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA2Q6UWI4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA2Q6UWI4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHISA2Q6UWI4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHISA2Q6UWI4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHISA2Q6UWI4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHISA2Q6UWI4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA2Q6UWI4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA2Q6UWI4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA2Q6UWI4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHISA2Q6UWI4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHISA2Q6UWI4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHISA2Q6UWI4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHISA2Q6UWI4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHISA2Q6UWI4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA2Q6UWI4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA2Q6UWI4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA2Q6UWI4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHISA2Q6UWI4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHISA2Q6UWI4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA2Q6UWI4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA2Q6UWI4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA2Q6UWI4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA2Q6UWI4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA2Q6UWI4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA2Q6UWI4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA2Q6UWI4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA2Q6UWI4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA2Q6UWI4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA2Q6UWI4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA2Q6UWI4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA2Q6UWI4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA2Q6UWI4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA2Q6UWI4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA2Q6UWI4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA2Q6UWI4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHISA2Q6UWI4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHISA2Q6UWI4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHISA2Q6UWI4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA2Q6UWI4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHISA2Q6UWI4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHISA2Q6UWI4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHISA2Q6UWI4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA2Q6UWI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA2Q6UWI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHISA2Q6UWI4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHISA2Q6UWI4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms