Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAB30Q15771 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RAB30Q15771 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAB30Q15771 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAB30Q15771 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RAB30Q15771 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RAB30Q15771 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAB30Q15771 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB30Q15771 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RAB30Q15771 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RAB30Q15771 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RAB30Q15771 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RAB30Q15771 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RAB30Q15771 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAB30Q15771 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAB30Q15771 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAB30Q15771 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RAB30Q15771 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RAB30Q15771 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RAB30Q15771 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RAB30Q15771 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAB30Q15771 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAB30Q15771 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RAB30Q15771 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RAB30Q15771 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RAB30Q15771 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAB30Q15771 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RAB30Q15771 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
RAB30Q15771 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
RAB30Q15771 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAB30Q15771 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAB30Q15771 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAB30Q15771 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAB30Q15771 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RAB30Q15771 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
RAB30Q15771 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAB30Q15771 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAB30Q15771 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB30Q15771 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB30Q15771 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB30Q15771 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RAB30Q15771 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RAB30Q15771 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB30Q15771 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RAB30Q15771 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAB30Q15771 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAB30Q15771 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAB30Q15771 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RAB30Q15771 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RAB30Q15771 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAB30Q15771 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAB30Q15771 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAB30Q15771 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAB30Q15771 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAB30Q15771 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAB30Q15771 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RAB30Q15771 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB30Q15771 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RAB30Q15771 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB30Q15771 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB30Q15771 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAB30Q15771 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB30Q15771 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RAB30Q15771 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RAB30Q15771 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAB30Q15771 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAB30Q15771 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB30Q15771 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB30Q15771 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB30Q15771 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB30Q15771 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RAB30Q15771 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAB30Q15771 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RAB30Q15771 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RAB30Q15771 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB30Q15771 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RAB30Q15771 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RAB30Q15771 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RAB30Q15771 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB30Q15771 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB30Q15771 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB30Q15771 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB30Q15771 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RAB30Q15771 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RAB30Q15771 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RAB30Q15771 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RAB30Q15771 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB30Q15771 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB30Q15771 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RAB30Q15771 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
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