Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CHD4Q14839 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CHD4Q14839 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CHD4Q14839 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CHD4Q14839 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CHD4Q14839 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CHD4Q14839 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CHD4Q14839 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CHD4Q14839 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CHD4Q14839 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CHD4Q14839 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CHD4Q14839 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CHD4Q14839 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CHD4Q14839 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CHD4Q14839 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CHD4Q14839 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHD4Q14839 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHD4Q14839 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CHD4Q14839 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
CHD4Q14839 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHD4Q14839 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CHD4Q14839 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHD4Q14839 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHD4Q14839 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHD4Q14839 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHD4Q14839 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CHD4Q14839 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD4Q14839 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHD4Q14839 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHD4Q14839 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHD4Q14839 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CHD4Q14839 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
CHD4Q14839 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CHD4Q14839 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CHD4Q14839 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CHD4Q14839 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
CHD4Q14839 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CHD4Q14839 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CHD4Q14839 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CHD4Q14839 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHD4Q14839 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHD4Q14839 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHD4Q14839 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CHD4Q14839 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CHD4Q14839 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CHD4Q14839 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CHD4Q14839 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHD4Q14839 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CHD4Q14839 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CHD4Q14839 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHD4Q14839 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CHD4Q14839 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CHD4Q14839 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CHD4Q14839 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CHD4Q14839 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CHD4Q14839 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHD4Q14839 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHD4Q14839 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CHD4Q14839 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHD4Q14839 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHD4Q14839 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHD4Q14839 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHD4Q14839 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHD4Q14839 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CHD4Q14839 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CHD4Q14839 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CHD4Q14839 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CHD4Q14839 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CHD4Q14839 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CHD4Q14839 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHD4Q14839 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CHD4Q14839 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHD4Q14839 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHD4Q14839 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CHD4Q14839 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHD4Q14839 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHD4Q14839 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CHD4Q14839 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CHD4Q14839 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CHD4Q14839 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHD4Q14839 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CHD4Q14839 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CHD4Q14839 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CHD4Q14839 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CHD4Q14839 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHD4Q14839 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CHD4Q14839 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CHD4Q14839 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CHD4Q14839 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CHD4Q14839 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CHD4Q14839 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CHD4Q14839 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CHD4Q14839 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHD4Q14839 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CHD4Q14839 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CHD4Q14839 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
CHD4Q14839 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CHD4Q14839 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHD4Q14839 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHD4Q14839 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
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