Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SRSF5Q13243 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SRSF5Q13243 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SRSF5Q13243 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SRSF5Q13243 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SRSF5Q13243 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SRSF5Q13243 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SRSF5Q13243 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SRSF5Q13243 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SRSF5Q13243 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SRSF5Q13243 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SRSF5Q13243 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SRSF5Q13243 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SRSF5Q13243 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SRSF5Q13243 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SRSF5Q13243 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SRSF5Q13243 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SRSF5Q13243 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SRSF5Q13243 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SRSF5Q13243 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRSF5Q13243 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRSF5Q13243 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRSF5Q13243 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRSF5Q13243 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SRSF5Q13243 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SRSF5Q13243 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SRSF5Q13243 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SRSF5Q13243 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
SRSF5Q13243 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SRSF5Q13243 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SRSF5Q13243 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SRSF5Q13243 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SRSF5Q13243 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SRSF5Q13243 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SRSF5Q13243 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SRSF5Q13243 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SRSF5Q13243 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SRSF5Q13243 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SRSF5Q13243 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SRSF5Q13243 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SRSF5Q13243 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRSF5Q13243 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRSF5Q13243 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SRSF5Q13243 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRSF5Q13243 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRSF5Q13243 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRSF5Q13243 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRSF5Q13243 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRSF5Q13243 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRSF5Q13243 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRSF5Q13243 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRSF5Q13243 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SRSF5Q13243 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SRSF5Q13243 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRSF5Q13243 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRSF5Q13243 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRSF5Q13243 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRSF5Q13243 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRSF5Q13243 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SRSF5Q13243 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRSF5Q13243 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRSF5Q13243 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRSF5Q13243 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRSF5Q13243 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRSF5Q13243 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SRSF5Q13243 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRSF5Q13243 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRSF5Q13243 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SRSF5Q13243 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRSF5Q13243 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRSF5Q13243 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRSF5Q13243 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRSF5Q13243 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRSF5Q13243 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRSF5Q13243 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRSF5Q13243 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRSF5Q13243 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRSF5Q13243 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRSF5Q13243 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRSF5Q13243 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRSF5Q13243 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRSF5Q13243 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRSF5Q13243 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRSF5Q13243 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRSF5Q13243 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRSF5Q13243 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SRSF5Q13243 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRSF5Q13243 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRSF5Q13243 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRSF5Q13243 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRSF5Q13243 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRSF5Q13243 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRSF5Q13243 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRSF5Q13243 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
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