Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.13■■■■■ 6.9
GRIN2BQ13224 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58■■■■■ 6.88
GRIN2BQ13224 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.37■■■■■ 6.77
GRIN2BQ13224 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.75■■■■■ 6.68
GRIN2BQ13224 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.08■■■■■ 6.57
GRIN2BQ13224 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.51■■■■■ 6.48
GRIN2BQ13224 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.49■■■■■ 6.47
GRIN2BQ13224 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.42■■■■■ 6.46
GRIN2BQ13224 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.36■■■■■ 6.45
GRIN2BQ13224 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
GRIN2BQ13224 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55■■■■■ 6.4
GRIN2BQ13224 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
GRIN2BQ13224 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.92■■■■■ 6.38
GRIN2BQ13224 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.91■■■■■ 6.38
GRIN2BQ13224 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
GRIN2BQ13224 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.32
GRIN2BQ13224 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.25
GRIN2BQ13224 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.05■■■■■ 6.24
GRIN2BQ13224 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.96■■■■■ 6.23
GRIN2BQ13224 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
GRIN2BQ13224 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
GRIN2BQ13224 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
GRIN2BQ13224 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
GRIN2BQ13224 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.6■■■■■ 6.17
GRIN2BQ13224 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.15
GRIN2BQ13224 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
GRIN2BQ13224 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.25■■■■■ 6.11
GRIN2BQ13224 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
GRIN2BQ13224 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.13■■■■■ 6.1
GRIN2BQ13224 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.07■■■■■ 6.09
GRIN2BQ13224 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
GRIN2BQ13224 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
GRIN2BQ13224 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
GRIN2BQ13224 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6.01
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.5■■■■■ 5.99
GRIN2BQ13224 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.4■■■■■ 5.98
GRIN2BQ13224 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
GRIN2BQ13224 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.21■■■■■ 5.95
GRIN2BQ13224 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
GRIN2BQ13224 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.9
GRIN2BQ13224 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.84■■■■■ 5.89
GRIN2BQ13224 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.59■■■■■ 5.85
GRIN2BQ13224 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
GRIN2BQ13224 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.48■■■■■ 5.83
GRIN2BQ13224 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
GRIN2BQ13224 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.41■■■■■ 5.82
GRIN2BQ13224 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
GRIN2BQ13224 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
GRIN2BQ13224 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.22■■■■■ 5.79
GRIN2BQ13224 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
GRIN2BQ13224 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
GRIN2BQ13224 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.16■■■■■ 5.78
GRIN2BQ13224 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
GRIN2BQ13224 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.1■■■■■ 5.77
GRIN2BQ13224 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.09■■■■■ 5.77
GRIN2BQ13224 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
GRIN2BQ13224 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
GRIN2BQ13224 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
GRIN2BQ13224 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
GRIN2BQ13224 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.84■■■■■ 5.73
GRIN2BQ13224 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
GRIN2BQ13224 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.75■■■■■ 5.71
GRIN2BQ13224 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.74■■■■■ 5.71
GRIN2BQ13224 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
GRIN2BQ13224 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
GRIN2BQ13224 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
GRIN2BQ13224 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
GRIN2BQ13224 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.5■■■■■ 5.67
GRIN2BQ13224 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
GRIN2BQ13224 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
GRIN2BQ13224 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
GRIN2BQ13224 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
GRIN2BQ13224 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
GRIN2BQ13224 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
GRIN2BQ13224 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.28■■■■■ 5.64
GRIN2BQ13224 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
GRIN2BQ13224 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
GRIN2BQ13224 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.2■■■■■ 5.63
GRIN2BQ13224 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
GRIN2BQ13224 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
GRIN2BQ13224 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
GRIN2BQ13224 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
GRIN2BQ13224 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.1■■■■■ 5.61
GRIN2BQ13224 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
GRIN2BQ13224 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
GRIN2BQ13224 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
GRIN2BQ13224 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
GRIN2BQ13224 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.94■■■■■ 5.59
GRIN2BQ13224 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.9■■■■■ 5.58
GRIN2BQ13224 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
GRIN2BQ13224 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
GRIN2BQ13224 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.85■■■■■ 5.57
GRIN2BQ13224 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.85■■■■■ 5.57
GRIN2BQ13224 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.84■■■■■ 5.57
GRIN2BQ13224 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
GRIN2BQ13224 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
GRIN2BQ13224 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.79■■■■■ 5.56
GRIN2BQ13224 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
GRIN2BQ13224 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
GRIN2BQ13224 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
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