Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANK3Q12955 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ANK3Q12955 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ANK3Q12955 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANK3Q12955 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANK3Q12955 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ANK3Q12955 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANK3Q12955 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANK3Q12955 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ANK3Q12955 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ANK3Q12955 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANK3Q12955 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANK3Q12955 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANK3Q12955 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANK3Q12955 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ANK3Q12955 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANK3Q12955 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANK3Q12955 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ANK3Q12955 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ANK3Q12955 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ANK3Q12955 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANK3Q12955 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANK3Q12955 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANK3Q12955 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANK3Q12955 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ANK3Q12955 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANK3Q12955 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANK3Q12955 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ANK3Q12955 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ANK3Q12955 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANK3Q12955 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ANK3Q12955 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ANK3Q12955 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANK3Q12955 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ANK3Q12955 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANK3Q12955 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANK3Q12955 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANK3Q12955 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANK3Q12955 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANK3Q12955 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANK3Q12955 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ANK3Q12955 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANK3Q12955 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANK3Q12955 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANK3Q12955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANK3Q12955 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANK3Q12955 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ANK3Q12955 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANK3Q12955 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ANK3Q12955 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ANK3Q12955 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ANK3Q12955 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ANK3Q12955 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ANK3Q12955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ANK3Q12955 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ANK3Q12955 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ANK3Q12955 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ANK3Q12955 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ANK3Q12955 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ANK3Q12955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANK3Q12955 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ANK3Q12955 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANK3Q12955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANK3Q12955 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANK3Q12955 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANK3Q12955 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANK3Q12955 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANK3Q12955 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANK3Q12955 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ANK3Q12955 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANK3Q12955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANK3Q12955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANK3Q12955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANK3Q12955 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANK3Q12955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANK3Q12955 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANK3Q12955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANK3Q12955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANK3Q12955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANK3Q12955 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANK3Q12955 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANK3Q12955 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANK3Q12955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANK3Q12955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANK3Q12955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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