Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
MUC3AQ02505 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MUC3AQ02505 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
MUC3AQ02505 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MUC3AQ02505 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
MUC3AQ02505 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MUC3AQ02505 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MUC3AQ02505 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MUC3AQ02505 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
MUC3AQ02505 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MUC3AQ02505 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MUC3AQ02505 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MUC3AQ02505 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MUC3AQ02505 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MUC3AQ02505 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MUC3AQ02505 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MUC3AQ02505 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MUC3AQ02505 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MUC3AQ02505 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
MUC3AQ02505 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MUC3AQ02505 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MUC3AQ02505 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MUC3AQ02505 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
MUC3AQ02505 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MUC3AQ02505 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MUC3AQ02505 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MUC3AQ02505 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MUC3AQ02505 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MUC3AQ02505 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MUC3AQ02505 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MUC3AQ02505 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MUC3AQ02505 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MUC3AQ02505 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
MUC3AQ02505 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MUC3AQ02505 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MUC3AQ02505 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MUC3AQ02505 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MUC3AQ02505 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MUC3AQ02505 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MUC3AQ02505 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MUC3AQ02505 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MUC3AQ02505 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MUC3AQ02505 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MUC3AQ02505 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MUC3AQ02505 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MUC3AQ02505 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MUC3AQ02505 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MUC3AQ02505 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MUC3AQ02505 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MUC3AQ02505 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MUC3AQ02505 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MUC3AQ02505 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MUC3AQ02505 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MUC3AQ02505 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MUC3AQ02505 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MUC3AQ02505 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MUC3AQ02505 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MUC3AQ02505 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MUC3AQ02505 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
MUC3AQ02505 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MUC3AQ02505 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MUC3AQ02505 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MUC3AQ02505 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MUC3AQ02505 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MUC3AQ02505 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MUC3AQ02505 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MUC3AQ02505 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MUC3AQ02505 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
MUC3AQ02505 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MUC3AQ02505 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MUC3AQ02505 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MUC3AQ02505 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
MUC3AQ02505 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MUC3AQ02505 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MUC3AQ02505 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
MUC3AQ02505 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MUC3AQ02505 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MUC3AQ02505 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MUC3AQ02505 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MUC3AQ02505 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MUC3AQ02505 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MUC3AQ02505 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MUC3AQ02505 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms