Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TGFB2P61812 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
TGFB2P61812 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
TGFB2P61812 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TGFB2P61812 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
TGFB2P61812 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TGFB2P61812 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TGFB2P61812 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TGFB2P61812 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TGFB2P61812 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TGFB2P61812 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TGFB2P61812 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TGFB2P61812 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
TGFB2P61812 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TGFB2P61812 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TGFB2P61812 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TGFB2P61812 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TGFB2P61812 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TGFB2P61812 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TGFB2P61812 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
TGFB2P61812 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TGFB2P61812 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TGFB2P61812 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TGFB2P61812 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TGFB2P61812 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TGFB2P61812 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TGFB2P61812 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
TGFB2P61812 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
TGFB2P61812 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
TGFB2P61812 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TGFB2P61812 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TGFB2P61812 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TGFB2P61812 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TGFB2P61812 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TGFB2P61812 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TGFB2P61812 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TGFB2P61812 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TGFB2P61812 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
TGFB2P61812 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TGFB2P61812 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TGFB2P61812 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TGFB2P61812 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
TGFB2P61812 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TGFB2P61812 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TGFB2P61812 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TGFB2P61812 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TGFB2P61812 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TGFB2P61812 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TGFB2P61812 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TGFB2P61812 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TGFB2P61812 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TGFB2P61812 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TGFB2P61812 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TGFB2P61812 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TGFB2P61812 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TGFB2P61812 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TGFB2P61812 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TGFB2P61812 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TGFB2P61812 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TGFB2P61812 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TGFB2P61812 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
TGFB2P61812 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TGFB2P61812 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TGFB2P61812 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TGFB2P61812 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TGFB2P61812 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TGFB2P61812 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TGFB2P61812 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
TGFB2P61812 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TGFB2P61812 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TGFB2P61812 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TGFB2P61812 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TGFB2P61812 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TGFB2P61812 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TGFB2P61812 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TGFB2P61812 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TGFB2P61812 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TGFB2P61812 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TGFB2P61812 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TGFB2P61812 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms