Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
IGF2RP11717 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IGF2RP11717 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IGF2RP11717 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGF2RP11717 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IGF2RP11717 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
IGF2RP11717 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGF2RP11717 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGF2RP11717 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IGF2RP11717 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
IGF2RP11717 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
IGF2RP11717 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IGF2RP11717 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IGF2RP11717 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGF2RP11717 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
IGF2RP11717 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IGF2RP11717 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IGF2RP11717 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IGF2RP11717 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
IGF2RP11717 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
IGF2RP11717 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
IGF2RP11717 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
IGF2RP11717 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
IGF2RP11717 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IGF2RP11717 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
IGF2RP11717 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IGF2RP11717 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IGF2RP11717 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGF2RP11717 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGF2RP11717 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IGF2RP11717 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGF2RP11717 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGF2RP11717 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGF2RP11717 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGF2RP11717 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGF2RP11717 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
IGF2RP11717 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGF2RP11717 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGF2RP11717 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
IGF2RP11717 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGF2RP11717 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGF2RP11717 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IGF2RP11717 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IGF2RP11717 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IGF2RP11717 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IGF2RP11717 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IGF2RP11717 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IGF2RP11717 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGF2RP11717 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGF2RP11717 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGF2RP11717 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGF2RP11717 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGF2RP11717 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGF2RP11717 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGF2RP11717 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IGF2RP11717 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGF2RP11717 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IGF2RP11717 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IGF2RP11717 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IGF2RP11717 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGF2RP11717 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IGF2RP11717 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IGF2RP11717 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IGF2RP11717 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IGF2RP11717 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IGF2RP11717 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IGF2RP11717 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IGF2RP11717 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IGF2RP11717 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGF2RP11717 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGF2RP11717 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGF2RP11717 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGF2RP11717 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGF2RP11717 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGF2RP11717 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGF2RP11717 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IGF2RP11717 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IGF2RP11717 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IGF2RP11717 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IGF2RP11717 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGF2RP11717 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGF2RP11717 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGF2RP11717 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGF2RP11717 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGF2RP11717 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGF2RP11717 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
IGF2RP11717 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGF2RP11717 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGF2RP11717 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGF2RP11717 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGF2RP11717 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGF2RP11717 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGF2RP11717 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGF2RP11717 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGF2RP11717 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms