Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.94■■■■■ 4.63
MMP10P09238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
MMP10P09238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
MMP10P09238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
MMP10P09238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
MMP10P09238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
MMP10P09238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
MMP10P09238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
MMP10P09238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
MMP10P09238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
MMP10P09238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
MMP10P09238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
MMP10P09238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
MMP10P09238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
MMP10P09238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
MMP10P09238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
MMP10P09238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
MMP10P09238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
MMP10P09238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
MMP10P09238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MMP10P09238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
MMP10P09238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
MMP10P09238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
MMP10P09238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
MMP10P09238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
MMP10P09238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
MMP10P09238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MMP10P09238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
MMP10P09238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
MMP10P09238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.06■■■■■ 4
MMP10P09238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MMP10P09238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
MMP10P09238 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
MMP10P09238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MMP10P09238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
MMP10P09238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
MMP10P09238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
MMP10P09238 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
MMP10P09238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MMP10P09238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MMP10P09238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
MMP10P09238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
MMP10P09238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MMP10P09238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
MMP10P09238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MMP10P09238 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MMP10P09238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
MMP10P09238 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
MMP10P09238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MMP10P09238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
MMP10P09238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
MMP10P09238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
MMP10P09238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
MMP10P09238 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MMP10P09238 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
MMP10P09238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
MMP10P09238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MMP10P09238 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
MMP10P09238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
MMP10P09238 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
MMP10P09238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
MMP10P09238 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
MMP10P09238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MMP10P09238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
MMP10P09238 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MMP10P09238 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MMP10P09238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MMP10P09238 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
MMP10P09238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MMP10P09238 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MMP10P09238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MMP10P09238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
MMP10P09238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
MMP10P09238 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MMP10P09238 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
MMP10P09238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MMP10P09238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
MMP10P09238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
MMP10P09238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MMP10P09238 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
MMP10P09238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
MMP10P09238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
MMP10P09238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MMP10P09238 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MMP10P09238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MMP10P09238 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
MMP10P09238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MMP10P09238 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
MMP10P09238 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
MMP10P09238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MMP10P09238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MMP10P09238 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MMP10P09238 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MMP10P09238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MMP10P09238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MMP10P09238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
MMP10P09238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MMP10P09238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MMP10P09238 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MMP10P09238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms