Protein–RNA interactions for Protein: C9JR72

KBTBD13, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD13C9JR72 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KBTBD13C9JR72 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
KBTBD13C9JR72 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
KBTBD13C9JR72 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
KBTBD13C9JR72 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KBTBD13C9JR72 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
KBTBD13C9JR72 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
KBTBD13C9JR72 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
KBTBD13C9JR72 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
KBTBD13C9JR72 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
KBTBD13C9JR72 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
KBTBD13C9JR72 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KBTBD13C9JR72 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KBTBD13C9JR72 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KBTBD13C9JR72 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KBTBD13C9JR72 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KBTBD13C9JR72 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KBTBD13C9JR72 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KBTBD13C9JR72 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KBTBD13C9JR72 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KBTBD13C9JR72 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KBTBD13C9JR72 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KBTBD13C9JR72 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KBTBD13C9JR72 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
KBTBD13C9JR72 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KBTBD13C9JR72 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KBTBD13C9JR72 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KBTBD13C9JR72 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KBTBD13C9JR72 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KBTBD13C9JR72 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
KBTBD13C9JR72 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
KBTBD13C9JR72 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KBTBD13C9JR72 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KBTBD13C9JR72 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KBTBD13C9JR72 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KBTBD13C9JR72 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KBTBD13C9JR72 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
KBTBD13C9JR72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
KBTBD13C9JR72 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KBTBD13C9JR72 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KBTBD13C9JR72 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KBTBD13C9JR72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KBTBD13C9JR72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KBTBD13C9JR72 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KBTBD13C9JR72 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KBTBD13C9JR72 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KBTBD13C9JR72 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KBTBD13C9JR72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KBTBD13C9JR72 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KBTBD13C9JR72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KBTBD13C9JR72 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KBTBD13C9JR72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KBTBD13C9JR72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KBTBD13C9JR72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KBTBD13C9JR72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KBTBD13C9JR72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KBTBD13C9JR72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KBTBD13C9JR72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KBTBD13C9JR72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KBTBD13C9JR72 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KBTBD13C9JR72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KBTBD13C9JR72 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KBTBD13C9JR72 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KBTBD13C9JR72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KBTBD13C9JR72 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KBTBD13C9JR72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KBTBD13C9JR72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KBTBD13C9JR72 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KBTBD13C9JR72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KBTBD13C9JR72 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KBTBD13C9JR72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KBTBD13C9JR72 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KBTBD13C9JR72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KBTBD13C9JR72 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KBTBD13C9JR72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KBTBD13C9JR72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KBTBD13C9JR72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KBTBD13C9JR72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KBTBD13C9JR72 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KBTBD13C9JR72 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KBTBD13C9JR72 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KBTBD13C9JR72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KBTBD13C9JR72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KBTBD13C9JR72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KBTBD13C9JR72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KBTBD13C9JR72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KBTBD13C9JR72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KBTBD13C9JR72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KBTBD13C9JR72 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KBTBD13C9JR72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KBTBD13C9JR72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KBTBD13C9JR72 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KBTBD13C9JR72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KBTBD13C9JR72 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD13C9JR72 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD13C9JR72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KBTBD13C9JR72 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KBTBD13C9JR72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KBTBD13C9JR72 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KBTBD13C9JR72 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms