Protein–RNA interactions for Protein: A6NE52

WDR97, WD repeat-containing protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 1,622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR97A6NE52 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.5■■■■■ 6.96
WDR97A6NE52 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.38■■■■■ 6.94
WDR97A6NE52 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.72■■■■■ 6.83
WDR97A6NE52 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.09■■■■■ 6.73
WDR97A6NE52 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.51■■■■■ 6.64
WDR97A6NE52 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.04■■■■■ 6.56
WDR97A6NE52 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.75■■■■■ 6.51
WDR97A6NE52 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.72■■■■■ 6.51
WDR97A6NE52 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
WDR97A6NE52 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.6■■■■■ 6.49
WDR97A6NE52 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC55.49■■■■■ 6.47
WDR97A6NE52 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.4■■■■■ 6.46
WDR97A6NE52 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.33■■■■■ 6.45
WDR97A6NE52 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.28■■■■■ 6.44
WDR97A6NE52 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.27■■■■■ 6.44
WDR97A6NE52 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
WDR97A6NE52 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.57■■■■■ 6.33
WDR97A6NE52 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
WDR97A6NE52 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
WDR97A6NE52 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.26■■■■■ 6.28
WDR97A6NE52 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
WDR97A6NE52 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
WDR97A6NE52 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
WDR97A6NE52 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.79■■■■■ 6.2
WDR97A6NE52 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.77■■■■■ 6.2
WDR97A6NE52 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.67■■■■■ 6.18
WDR97A6NE52 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.59■■■■■ 6.17
WDR97A6NE52 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.48■■■■■ 6.15
WDR97A6NE52 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
WDR97A6NE52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.43■■■■■ 6.14
WDR97A6NE52 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.34■■■■■ 6.13
WDR97A6NE52 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
WDR97A6NE52 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.28■■■■■ 6.12
WDR97A6NE52 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.94■■■■■ 6.06
WDR97A6NE52 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.84■■■■■ 6.05
WDR97A6NE52 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.67■■■■■ 6.02
WDR97A6NE52 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.63■■■■■ 6.02
WDR97A6NE52 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
WDR97A6NE52 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
WDR97A6NE52 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.35■■■■■ 5.97
WDR97A6NE52 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.22■■■■■ 5.95
WDR97A6NE52 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
WDR97A6NE52 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
WDR97A6NE52 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
WDR97A6NE52 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
WDR97A6NE52 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.64■■■■■ 5.86
WDR97A6NE52 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.64■■■■■ 5.86
WDR97A6NE52 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
WDR97A6NE52 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.53■■■■■ 5.84
WDR97A6NE52 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.47■■■■■ 5.83
WDR97A6NE52 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
WDR97A6NE52 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.42■■■■■ 5.82
WDR97A6NE52 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.4■■■■■ 5.82
WDR97A6NE52 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
WDR97A6NE52 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
WDR97A6NE52 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
WDR97A6NE52 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
WDR97A6NE52 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
WDR97A6NE52 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.78
WDR97A6NE52 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
WDR97A6NE52 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
WDR97A6NE52 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.05■■■■■ 5.76
WDR97A6NE52 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.03■■■■■ 5.76
WDR97A6NE52 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
WDR97A6NE52 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
WDR97A6NE52 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.97■■■■■ 5.75
WDR97A6NE52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
WDR97A6NE52 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
WDR97A6NE52 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.83■■■■■ 5.73
WDR97A6NE52 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
WDR97A6NE52 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.7■■■■■ 5.71
WDR97A6NE52 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
WDR97A6NE52 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
WDR97A6NE52 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
WDR97A6NE52 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
WDR97A6NE52 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
WDR97A6NE52 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
WDR97A6NE52 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.43■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
WDR97A6NE52 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
WDR97A6NE52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
WDR97A6NE52 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
WDR97A6NE52 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
WDR97A6NE52 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.21■■■■■ 5.63
WDR97A6NE52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
WDR97A6NE52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
WDR97A6NE52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.15■■■■■ 5.62
WDR97A6NE52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.14■■■■■ 5.62
WDR97A6NE52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
WDR97A6NE52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
WDR97A6NE52 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
WDR97A6NE52 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
WDR97A6NE52 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
WDR97A6NE52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC50.03■■■■■ 5.6
WDR97A6NE52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms