Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 USP7-203ENST00000542333 1966 ntTSL 29.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 USP7-207ENST00000563085 3194 ntTSL 26.7□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 USP7-210ENST00000565455 3554 ntTSL 25.6□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-204ENST00000451047 555 ntTSL 322.93■■□□□ 1.266e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-208ENST00000481071 1905 ntTSL 520■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-205ENST00000459928 2139 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-209ENST00000487192 2196 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 ANO7-201ENST00000274979 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 183.5
UTP3Q9NQZ2 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 520.14■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 183.4
UTP3Q9NQZ2 GNA12-205ENST00000471281 1205 ntTSL 314.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 183.4
UTP3Q9NQZ2 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 183.4
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.417e-7■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 519.86■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-212ENST00000521469 2741 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 CLK3-213ENST00000563842 860 ntTSL 514.23□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 FNDC3A-201ENST00000378383 2037 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 183.3
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 319.05■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 183.2
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN1-216ENST00000534042 574 ntTSL 517.79■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 183.2
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 183.1
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 183.1
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 218.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 183.1
UTP3Q9NQZ2 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 183.1
UTP3Q9NQZ2 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 333.72■■■□□ 2.992e-13■■■■■ 183
UTP3Q9NQZ2 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 331.59■■■□□ 2.652e-13■■■■■ 183
UTP3Q9NQZ2 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 183
UTP3Q9NQZ2 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 183
UTP3Q9NQZ2 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 183
UTP3Q9NQZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 182.9
UTP3Q9NQZ2 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 182.9
UTP3Q9NQZ2 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 182.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 182.8
UTP3Q9NQZ2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 218.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 DAB2-213ENST00000512525 693 ntTSL 39.89□□□□□ -0.839e-12■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 182.7
UTP3Q9NQZ2 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 182.6
UTP3Q9NQZ2 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 182.6
UTP3Q9NQZ2 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 182.6
UTP3Q9NQZ2 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 182.6
UTP3Q9NQZ2 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 182.5
UTP3Q9NQZ2 TRUB2-202ENST00000460320 933 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 182.5
UTP3Q9NQZ2 PCNT-207ENST00000483844 734 ntTSL 311.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 182.4
UTP3Q9NQZ2 DLEU1-224ENST00000483444 332 ntTSL 1 (best)4.12□□□□□ -1.752e-6■■■■■ 182.4
UTP3Q9NQZ2 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.63□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 182.3
UTP3Q9NQZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 182.3
UTP3Q9NQZ2 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 311.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 182.3
UTP3Q9NQZ2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-203ENST00000543382 2504 ntTSL 217.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-220ENST00000593205 629 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 SFSWAP-208ENST00000539506 3149 ntTSL 513.68□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-211ENST00000538345 498 ntTSL 513□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-222ENST00000617806 4865 ntTSL 512.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-202ENST00000438274 1569 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 BECN1-217ENST00000591085 559 ntTSL 49.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 182.2
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-205ENST00000558217 882 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-210ENST00000560409 819 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 182.1
UTP3Q9NQZ2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 182
UTP3Q9NQZ2 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 182
UTP3Q9NQZ2 SYNE4-205ENST00000490730 1175 ntTSL 222.27■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 181.9
UTP3Q9NQZ2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 181.9
UTP3Q9NQZ2 SYNE4-204ENST00000465425 2339 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 181.9
UTP3Q9NQZ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 181.9
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 181.9
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.358e-7■■■■■ 181.8
UTP3Q9NQZ2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 181.8
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.273e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-202ENST00000460322 889 ntTSL 522.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-213ENST00000488118 4384 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-216ENST00000494564 611 ntTSL 311.3□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 XPNPEP1-227ENST00000510988 589 ntTSL 36.44□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-204ENST00000468921 512 ntTSL 519.18■□□□□ 0.663e-18■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 TEX264-206ENST00000419358 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.67■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 TEX264-207ENST00000425781 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 TEX264-203ENST00000412249 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 181.7
UTP3Q9NQZ2 RNF185-207ENST00000518626 2737 ntTSL 213.72□□□□□ -0.213e-18■■■■■ 181.7
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