RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490730.1

SYNE4-205, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 1,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-205ENST00000490730 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.17■■■■■ 5.94
SYNE4-205ENST00000490730 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.76■■■■■ 5.08
SYNE4-205ENST00000490730 ABCC9O60706 1549 aa46.6■■■■■ 5.05
SYNE4-205ENST00000490730 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.42■■■■■ 4.7
SYNE4-205ENST00000490730 NACADO15069 1562 aa44.13■■■■■ 4.65
SYNE4-205ENST00000490730 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.07■■■■■ 4.65
SYNE4-205ENST00000490730 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.52■■■■■ 4.56
SYNE4-205ENST00000490730 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.45■■■■■ 4.55
SYNE4-205ENST00000490730 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.44■■■■■ 4.54
SYNE4-205ENST00000490730 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
SYNE4-205ENST00000490730 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
SYNE4-205ENST00000490730 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.08■■■■■ 4.49
SYNE4-205ENST00000490730 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.06■■■■■ 4.48
SYNE4-205ENST00000490730 SCRIBQ14160 1630 aa42.7■■■■■ 4.43
SYNE4-205ENST00000490730 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
SYNE4-205ENST00000490730 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.09■■■■■ 4.33
SYNE4-205ENST00000490730 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
SYNE4-205ENST00000490730 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.93■■■■■ 4.3
SYNE4-205ENST00000490730 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
SYNE4-205ENST00000490730 NCAPD3P42695 1498 aa40.7■■■■■ 4.11
SYNE4-205ENST00000490730 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.64■■■■■ 4.1
SYNE4-205ENST00000490730 SMARCA2P51531 1590 aa40.57■■■■■ 4.08
SYNE4-205ENST00000490730 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
SYNE4-205ENST00000490730 HMGXB3Q12766 1538 aa40.46■■■■■ 4.07
SYNE4-205ENST00000490730 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SYNE4-205ENST00000490730 ERCC6Q03468 1493 aa40.25■■■■■ 4.03
SYNE4-205ENST00000490730 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.23■■■■■ 4.03
SYNE4-205ENST00000490730 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.23■■■■■ 4.03
SYNE4-205ENST00000490730 NESP48681 1621 aa40.08■■■■■ 4.01
SYNE4-205ENST00000490730 CUX2O14529 1486 aa40.02■■■■■ 4
SYNE4-205ENST00000490730 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.8■■■■□ 3.96
SYNE4-205ENST00000490730 WIZO95785 1651 aa39.8■■■■□ 3.96
SYNE4-205ENST00000490730 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.73■■■■□ 3.95
SYNE4-205ENST00000490730 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
SYNE4-205ENST00000490730 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.6■■■■□ 3.93
SYNE4-205ENST00000490730 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.57■■■■□ 3.92
SYNE4-205ENST00000490730 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.5■■■■□ 3.91
SYNE4-205ENST00000490730 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
SYNE4-205ENST00000490730 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
SYNE4-205ENST00000490730 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.23■■■■□ 3.87
SYNE4-205ENST00000490730 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.13■■■■□ 3.85
SYNE4-205ENST00000490730 WDR62O43379 1518 aa39.11■■■■□ 3.85
SYNE4-205ENST00000490730 CFTRP13569 1480 aa39.09■■■■□ 3.85
SYNE4-205ENST00000490730 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.09■■■■□ 3.85
SYNE4-205ENST00000490730 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.81■■■■□ 3.8
SYNE4-205ENST00000490730 PRDM2Q13029 1718 aa38.8■■■■□ 3.8
SYNE4-205ENST00000490730 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SYNE4-205ENST00000490730 TOPBP1Q92547 1522 aa38.37■■■■□ 3.73
SYNE4-205ENST00000490730 IFT140Q96RY7 1462 aa38.31■■■■□ 3.72
SYNE4-205ENST00000490730 ABCC8Q09428 1581 aa38.27■■■■□ 3.72
SYNE4-205ENST00000490730 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.27■■■■□ 3.72
SYNE4-205ENST00000490730 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
SYNE4-205ENST00000490730 OSCARQ8IYS5 282 aa38.23■■■■□ 3.71
SYNE4-205ENST00000490730 TRIM41Q8WV44 630 aa38.21■■■■□ 3.71
SYNE4-205ENST00000490730 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
SYNE4-205ENST00000490730 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
SYNE4-205ENST00000490730 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
SYNE4-205ENST00000490730 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
SYNE4-205ENST00000490730 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.663e-7■■■■■ 30.6
SYNE4-205ENST00000490730 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.87■■■■□ 3.65
SYNE4-205ENST00000490730 SOGA1O94964 1423 aa37.82■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.8■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 CHD1O14646 1710 aa37.79■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 CUX1P39880 1505 aa37.79■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.76■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.76■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.76■■■■□ 3.64
SYNE4-205ENST00000490730 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
SYNE4-205ENST00000490730 FBLN2P98095 1184 aa37.71■■■■□ 3.63
SYNE4-205ENST00000490730 ARHGEF11O15085 1522 aa37.64■■■■□ 3.62
SYNE4-205ENST00000490730 WDR97A6NE52 1622 aa37.61■■■■□ 3.61
SYNE4-205ENST00000490730 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.57■■■■□ 3.6
SYNE4-205ENST00000490730 GRIN2BQ13224 1484 aa37.47■■■■□ 3.59
SYNE4-205ENST00000490730 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
SYNE4-205ENST00000490730 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
SYNE4-205ENST00000490730 PBRM1Q86U86 1689 aa37.41■■■■□ 3.58
SYNE4-205ENST00000490730 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.38■■■■□ 3.57
SYNE4-205ENST00000490730 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.37■■■■□ 3.57
SYNE4-205ENST00000490730 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.35■■■■□ 3.57
SYNE4-205ENST00000490730 SYNJ2O15056 1496 aa37.33■■■■□ 3.57
SYNE4-205ENST00000490730 SYNJ1O43426 1573 aa37.32■■■■□ 3.56
SYNE4-205ENST00000490730 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.3■■■■□ 3.56
SYNE4-205ENST00000490730 ARAP1Q96P48 1450 aa37.28■■■■□ 3.56
SYNE4-205ENST00000490730 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.28■■■■□ 3.56
SYNE4-205ENST00000490730 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.26■■■■□ 3.55
SYNE4-205ENST00000490730 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.25■■■■□ 3.55
SYNE4-205ENST00000490730 TOP2BQ02880 1626 aa37.25■■■■□ 3.55
SYNE4-205ENST00000490730 ADAMTS12P58397 1594 aa37.03■■■■□ 3.52
SYNE4-205ENST00000490730 GRIN2AQ12879 1464 aa37■■■■□ 3.51
SYNE4-205ENST00000490730 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
SYNE4-205ENST00000490730 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.89■■■■□ 3.5
SYNE4-205ENST00000490730 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.89■■■■□ 3.5
SYNE4-205ENST00000490730 CEP170Q5SW79 1584 aa36.87■■■■□ 3.49
SYNE4-205ENST00000490730 NUP160Q12769 1436 aa36.83■■■■□ 3.49
SYNE4-205ENST00000490730 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.75■■■■□ 3.47
SYNE4-205ENST00000490730 SHROOM2Q13796 1616 aa36.66■■■■□ 3.46
SYNE4-205ENST00000490730 KIF27Q86VH2 1401 aa36.52■■■■□ 3.44
SYNE4-205ENST00000490730 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
SYNE4-205ENST00000490730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.5■■■■□ 3.43
SYNE4-205ENST00000490730 JPH4Q96JJ6 628 aa36.46■■■■□ 3.43
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