Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP1P29466 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP1P29466 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP1P29466 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms