RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000230301.8

C6orf118-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 118, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf118, Length 1,812 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf118-201ENST00000230301 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.07■■■■■ 4.16
C6orf118-201ENST00000230301 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.56■■■■□ 3.28
C6orf118-201ENST00000230301 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
C6orf118-201ENST00000230301 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.98■■■■□ 3.03
C6orf118-201ENST00000230301 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.96■■■■□ 3.03
C6orf118-201ENST00000230301 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.85■■■■□ 3.01
C6orf118-201ENST00000230301 ABCC9O60706 1549 aa33.5■■■□□ 2.95
C6orf118-201ENST00000230301 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.27■■■□□ 2.92
C6orf118-201ENST00000230301 NACADO15069 1562 aa33.05■■■□□ 2.88
C6orf118-201ENST00000230301 SCRIBQ14160 1630 aa32.92■■■□□ 2.86
C6orf118-201ENST00000230301 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
C6orf118-201ENST00000230301 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.71■■■□□ 2.83
C6orf118-201ENST00000230301 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.15■■■□□ 2.74
C6orf118-201ENST00000230301 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
C6orf118-201ENST00000230301 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.99■■■□□ 2.71
C6orf118-201ENST00000230301 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
C6orf118-201ENST00000230301 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.8■■■□□ 2.68
C6orf118-201ENST00000230301 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
C6orf118-201ENST00000230301 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
C6orf118-201ENST00000230301 WIZO95785 1651 aa31.59■■■□□ 2.65
C6orf118-201ENST00000230301 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.56■■■□□ 2.64
C6orf118-201ENST00000230301 SMARCA4P51532 1647 aa31.5■■■□□ 2.63
C6orf118-201ENST00000230301 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
C6orf118-201ENST00000230301 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.02■■■□□ 2.56
C6orf118-201ENST00000230301 SMARCA2P51531 1590 aa30.94■■■□□ 2.54
C6orf118-201ENST00000230301 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.94■■■□□ 2.54
C6orf118-201ENST00000230301 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.9■■■□□ 2.54
C6orf118-201ENST00000230301 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
C6orf118-201ENST00000230301 TRIM41Q8WV44 630 aa30.75■■■□□ 2.51
C6orf118-201ENST00000230301 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
C6orf118-201ENST00000230301 NCAPD3P42695 1498 aa30.53■■■□□ 2.48
C6orf118-201ENST00000230301 HMGXB3Q12766 1538 aa30.49■■■□□ 2.47
C6orf118-201ENST00000230301 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.46■■■□□ 2.47
C6orf118-201ENST00000230301 ABCC8Q09428 1581 aa30.45■■■□□ 2.47
C6orf118-201ENST00000230301 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
C6orf118-201ENST00000230301 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.26■■■□□ 2.44
C6orf118-201ENST00000230301 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
C6orf118-201ENST00000230301 SYNJ1O43426 1573 aa30.04■■■□□ 2.4
C6orf118-201ENST00000230301 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.98■■■□□ 2.39
C6orf118-201ENST00000230301 CFTRP13569 1480 aa29.96■■■□□ 2.39
C6orf118-201ENST00000230301 SOGA1O94964 1423 aa29.95■■■□□ 2.38
C6orf118-201ENST00000230301 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.86■■■□□ 2.37
C6orf118-201ENST00000230301 TOP2BQ02880 1626 aa29.81■■■□□ 2.36
C6orf118-201ENST00000230301 PRDM2Q13029 1718 aa29.81■■■□□ 2.36
C6orf118-201ENST00000230301 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.8■■■□□ 2.36
C6orf118-201ENST00000230301 EEA1Q15075 1411 aa29.79■■■□□ 2.36
C6orf118-201ENST00000230301 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.78■■■□□ 2.36
C6orf118-201ENST00000230301 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.72■■■□□ 2.35
C6orf118-201ENST00000230301 CUX1P39880 1505 aa29.71■■■□□ 2.35
C6orf118-201ENST00000230301 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.56■■■□□ 2.32
C6orf118-201ENST00000230301 NESP48681 1621 aa29.54■■■□□ 2.32
C6orf118-201ENST00000230301 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.5■■■□□ 2.31
C6orf118-201ENST00000230301 GOLGA3Q08378 1498 aa29.48■■■□□ 2.31
C6orf118-201ENST00000230301 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.46■■■□□ 2.31
C6orf118-201ENST00000230301 KIF21BO75037 1637 aa29.45■■■□□ 2.3
C6orf118-201ENST00000230301 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.42■■■□□ 2.3
C6orf118-201ENST00000230301 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.41■■■□□ 2.3
C6orf118-201ENST00000230301 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
C6orf118-201ENST00000230301 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.39■■■□□ 2.3
C6orf118-201ENST00000230301 CEP162Q5TB80 1403 aa29.36■■■□□ 2.29
C6orf118-201ENST00000230301 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.32■■■□□ 2.28
C6orf118-201ENST00000230301 KIF27Q86VH2 1401 aa29.3■■■□□ 2.28
C6orf118-201ENST00000230301 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.29■■■□□ 2.28
C6orf118-201ENST00000230301 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.27■■■□□ 2.28
C6orf118-201ENST00000230301 TOPBP1Q92547 1522 aa29.23■■■□□ 2.27
C6orf118-201ENST00000230301 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
C6orf118-201ENST00000230301 PRXQ9BXM0 1461 aa29.21■■■□□ 2.27
C6orf118-201ENST00000230301 CUX2O14529 1486 aa29.2■■■□□ 2.27
C6orf118-201ENST00000230301 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.19■■■□□ 2.26
C6orf118-201ENST00000230301 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
C6orf118-201ENST00000230301 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
C6orf118-201ENST00000230301 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.13■■■□□ 2.25
C6orf118-201ENST00000230301 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
C6orf118-201ENST00000230301 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.1■■■□□ 2.25
C6orf118-201ENST00000230301 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
C6orf118-201ENST00000230301 IGF1RP08069 1367 aa29.06■■■□□ 2.24
C6orf118-201ENST00000230301 CLIP1P30622 1438 aa29.04■■■□□ 2.24
C6orf118-201ENST00000230301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.01■■■□□ 2.23
C6orf118-201ENST00000230301 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
C6orf118-201ENST00000230301 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.91■■■□□ 2.22
C6orf118-201ENST00000230301 WDR97A6NE52 1622 aa28.9■■■□□ 2.22
C6orf118-201ENST00000230301 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.83■■■□□ 2.21
C6orf118-201ENST00000230301 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.82■■■□□ 2.2
C6orf118-201ENST00000230301 HRCP23327 699 aa28.8■■■□□ 2.2
C6orf118-201ENST00000230301 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
C6orf118-201ENST00000230301 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.76■■■□□ 2.19
C6orf118-201ENST00000230301 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
C6orf118-201ENST00000230301 ARAP1Q96P48 1450 aa28.75■■■□□ 2.19
C6orf118-201ENST00000230301 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
C6orf118-201ENST00000230301 CUL7Q14999 1698 aa28.72■■■□□ 2.19
C6orf118-201ENST00000230301 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.7■■■□□ 2.18
C6orf118-201ENST00000230301 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.66■■■□□ 2.18
C6orf118-201ENST00000230301 WDR62O43379 1518 aa28.64■■■□□ 2.18
C6orf118-201ENST00000230301 ERCC6Q03468 1493 aa28.62■■■□□ 2.17
C6orf118-201ENST00000230301 APLP2Q06481 763 aa28.55■■■□□ 2.16
C6orf118-201ENST00000230301 PBRM1Q86U86 1689 aa28.53■■■□□ 2.16
C6orf118-201ENST00000230301 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
C6orf118-201ENST00000230301 IFT140Q96RY7 1462 aa28.52■■■□□ 2.16
C6orf118-201ENST00000230301 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
C6orf118-201ENST00000230301 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms