RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.7■■■■■ 4.11
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXC11-201ENST00000243082 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXC11-201ENST00000243082 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXC11-201ENST00000243082 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXC11-201ENST00000243082 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.58■■■□□ 2.97
HOXC11-201ENST00000243082 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.97■■■□□ 2.87
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC9O60706 1549 aa32.94■■■□□ 2.86
HOXC11-201ENST00000243082 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXC11-201ENST00000243082 NACADO15069 1562 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXC11-201ENST00000243082 SCRIBQ14160 1630 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXC11-201ENST00000243082 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC11-201ENST00000243082 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
HOXC11-201ENST00000243082 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC11-201ENST00000243082 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXC11-201ENST00000243082 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXC11-201ENST00000243082 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXC11-201ENST00000243082 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXC11-201ENST00000243082 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXC11-201ENST00000243082 WIZO95785 1651 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXC11-201ENST00000243082 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.59
HOXC11-201ENST00000243082 SMARCA4P51532 1647 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXC11-201ENST00000243082 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
HOXC11-201ENST00000243082 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC11-201ENST00000243082 SMARCA2P51531 1590 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM41Q8WV44 630 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXC11-201ENST00000243082 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
HOXC11-201ENST00000243082 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXC11-201ENST00000243082 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXC11-201ENST00000243082 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC8Q09428 1581 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXC11-201ENST00000243082 NCAPD3P42695 1498 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC11-201ENST00000243082 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXC11-201ENST00000243082 HMGXB3Q12766 1538 aa30.14■■■□□ 2.41
HOXC11-201ENST00000243082 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
HOXC11-201ENST00000243082 SYNJ1O43426 1573 aa29.78■■■□□ 2.36
HOXC11-201ENST00000243082 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXC11-201ENST00000243082 SOGA1O94964 1423 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXC11-201ENST00000243082 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXC11-201ENST00000243082 EEA1Q15075 1411 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC11-201ENST00000243082 CFTRP13569 1480 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXC11-201ENST00000243082 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXC11-201ENST00000243082 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXC11-201ENST00000243082 TOP2BQ02880 1626 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXC11-201ENST00000243082 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXC11-201ENST00000243082 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.51■■■□□ 2.32
HOXC11-201ENST00000243082 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXC11-201ENST00000243082 PRDM2Q13029 1718 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXC11-201ENST00000243082 CUX1P39880 1505 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXC11-201ENST00000243082 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXC11-201ENST00000243082 GOLGA3Q08378 1498 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXC11-201ENST00000243082 KIF21BO75037 1637 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXC11-201ENST00000243082 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXC11-201ENST00000243082 CEP162Q5TB80 1403 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXC11-201ENST00000243082 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXC11-201ENST00000243082 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXC11-201ENST00000243082 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXC11-201ENST00000243082 NESP48681 1621 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXC11-201ENST00000243082 KIF27Q86VH2 1401 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXC11-201ENST00000243082 HRCP23327 699 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXC11-201ENST00000243082 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXC11-201ENST00000243082 PRXQ9BXM0 1461 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXC11-201ENST00000243082 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXC11-201ENST00000243082 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29■■■□□ 2.23
HOXC11-201ENST00000243082 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXC11-201ENST00000243082 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXC11-201ENST00000243082 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXC11-201ENST00000243082 CLIP1P30622 1438 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXC11-201ENST00000243082 CUX2O14529 1486 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXC11-201ENST00000243082 TOPBP1Q92547 1522 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXC11-201ENST00000243082 IGF1RP08069 1367 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXC11-201ENST00000243082 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXC11-201ENST00000243082 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
HOXC11-201ENST00000243082 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXC11-201ENST00000243082 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXC11-201ENST00000243082 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXC11-201ENST00000243082 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXC11-201ENST00000243082 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXC11-201ENST00000243082 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC11-201ENST00000243082 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXC11-201ENST00000243082 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HOXC11-201ENST00000243082 ARAP1Q96P48 1450 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXC11-201ENST00000243082 WDR97A6NE52 1622 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXC11-201ENST00000243082 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 CUL7Q14999 1698 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 APLP2Q06481 763 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC11-201ENST00000243082 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
HOXC11-201ENST00000243082 WDR62O43379 1518 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXC11-201ENST00000243082 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXC11-201ENST00000243082 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXC11-201ENST00000243082 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXC11-201ENST00000243082 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
HOXC11-201ENST00000243082 IFT140Q96RY7 1462 aa28.15■■■□□ 2.1
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