RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589424.5

USP36-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP36, Length 970 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-216ENST00000589424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.65■■■■■ 5.54
USP36-216ENST00000589424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.64■■■■■ 4.74
USP36-216ENST00000589424 ABCC9O60706 1549 aa44.57■■■■■ 4.73
USP36-216ENST00000589424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.45■■■■■ 4.39
USP36-216ENST00000589424 NACADO15069 1562 aa42.14■■■■■ 4.34
USP36-216ENST00000589424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.8■■■■■ 4.28
USP36-216ENST00000589424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.76■■■■■ 4.28
USP36-216ENST00000589424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.59■■■■■ 4.25
USP36-216ENST00000589424 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.54■■■■■ 4.24
USP36-216ENST00000589424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
USP36-216ENST00000589424 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.24■■■■■ 4.19
USP36-216ENST00000589424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
USP36-216ENST00000589424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.02■■■■■ 4.16
USP36-216ENST00000589424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.66■■■■■ 4.1
USP36-216ENST00000589424 SCRIBQ14160 1630 aa40.65■■■■■ 4.1
USP36-216ENST00000589424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.31■■■■■ 4.04
USP36-216ENST00000589424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
USP36-216ENST00000589424 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
USP36-216ENST00000589424 NCAPD3P42695 1498 aa38.87■■■■□ 3.81
USP36-216ENST00000589424 SMARCA4P51532 1647 aa38.78■■■■□ 3.8
USP36-216ENST00000589424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.76■■■■□ 3.8
USP36-216ENST00000589424 SMARCA2P51531 1590 aa38.69■■■■□ 3.78
USP36-216ENST00000589424 HMGXB3Q12766 1538 aa38.63■■■■□ 3.78
USP36-216ENST00000589424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
USP36-216ENST00000589424 ERCC6Q03468 1493 aa38.48■■■■□ 3.75
USP36-216ENST00000589424 CUX2O14529 1486 aa38.42■■■■□ 3.74
USP36-216ENST00000589424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
USP36-216ENST00000589424 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.39■■■■□ 3.74
USP36-216ENST00000589424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.35■■■■□ 3.73
USP36-216ENST00000589424 NESP48681 1621 aa38.3■■■■□ 3.72
USP36-216ENST00000589424 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.27■■■■□ 3.72
USP36-216ENST00000589424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.05■■■■□ 3.68
USP36-216ENST00000589424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
USP36-216ENST00000589424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.88■■■■□ 3.65
USP36-216ENST00000589424 WIZO95785 1651 aa37.84■■■■□ 3.65
USP36-216ENST00000589424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.77■■■■□ 3.64
USP36-216ENST00000589424 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.67■■■■□ 3.62
USP36-216ENST00000589424 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.49■■■■□ 3.59
USP36-216ENST00000589424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
USP36-216ENST00000589424 WDR62O43379 1518 aa37.42■■■■□ 3.58
USP36-216ENST00000589424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
USP36-216ENST00000589424 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.33■■■■□ 3.57
USP36-216ENST00000589424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.28■■■■□ 3.56
USP36-216ENST00000589424 CFTRP13569 1480 aa37.26■■■■□ 3.56
USP36-216ENST00000589424 PRDM2Q13029 1718 aa37.03■■■■□ 3.52
USP36-216ENST00000589424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
USP36-216ENST00000589424 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.88■■■■□ 3.49
USP36-216ENST00000589424 TRIM41Q8WV44 630 aa36.67■■■■□ 3.46
USP36-216ENST00000589424 OSCARQ8IYS5 282 aa36.59■■■■□ 3.45
USP36-216ENST00000589424 TOPBP1Q92547 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
USP36-216ENST00000589424 IFT140Q96RY7 1462 aa36.57■■■■□ 3.45
USP36-216ENST00000589424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
USP36-216ENST00000589424 ABCC8Q09428 1581 aa36.48■■■■□ 3.43
USP36-216ENST00000589424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.48■■■■□ 3.43
USP36-216ENST00000589424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
USP36-216ENST00000589424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
USP36-216ENST00000589424 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
USP36-216ENST00000589424 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
USP36-216ENST00000589424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.24■■■■□ 3.39
USP36-216ENST00000589424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
USP36-216ENST00000589424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
USP36-216ENST00000589424 CHD1O14646 1710 aa36.15■■■■□ 3.38
USP36-216ENST00000589424 ARHGEF11O15085 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
USP36-216ENST00000589424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.05■■■■□ 3.36
USP36-216ENST00000589424 SOGA1O94964 1423 aa36■■■■□ 3.35
USP36-216ENST00000589424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.99■■■■□ 3.35
USP36-216ENST00000589424 CUX1P39880 1505 aa35.97■■■■□ 3.35
USP36-216ENST00000589424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
USP36-216ENST00000589424 WDR97A6NE52 1622 aa35.92■■■■□ 3.34
USP36-216ENST00000589424 FBLN2P98095 1184 aa35.89■■■■□ 3.34
USP36-216ENST00000589424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.84■■■■□ 3.33
USP36-216ENST00000589424 ARAP1Q96P48 1450 aa35.74■■■■□ 3.31
USP36-216ENST00000589424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.74■■■■□ 3.31
USP36-216ENST00000589424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
USP36-216ENST00000589424 GRIN2BQ13224 1484 aa35.72■■■■□ 3.31
USP36-216ENST00000589424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
USP36-216ENST00000589424 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.68■■■■□ 3.3
USP36-216ENST00000589424 PBRM1Q86U86 1689 aa35.68■■■■□ 3.3
USP36-216ENST00000589424 SYNJ1O43426 1573 aa35.64■■■■□ 3.3
USP36-216ENST00000589424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
USP36-216ENST00000589424 SYNJ2O15056 1496 aa35.61■■■■□ 3.29
USP36-216ENST00000589424 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.59■■■■□ 3.29
USP36-216ENST00000589424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.57■■■■□ 3.29
USP36-216ENST00000589424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.57■■■■□ 3.28
USP36-216ENST00000589424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.43■■■■□ 3.26
USP36-216ENST00000589424 TOP2BQ02880 1626 aa35.4■■■■□ 3.26
USP36-216ENST00000589424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.4■■■■□ 3.26
USP36-216ENST00000589424 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
USP36-216ENST00000589424 ADAMTS12P58397 1594 aa35.3■■■■□ 3.24
USP36-216ENST00000589424 GRIN2AQ12879 1464 aa35.28■■■■□ 3.24
USP36-216ENST00000589424 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
USP36-216ENST00000589424 NUP160Q12769 1436 aa35.15■■■■□ 3.22
USP36-216ENST00000589424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.13■■■■□ 3.21
USP36-216ENST00000589424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.13■■■■□ 3.21
USP36-216ENST00000589424 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.13■■■■□ 3.21
USP36-216ENST00000589424 SHROOM2Q13796 1616 aa35.06■■■■□ 3.2
USP36-216ENST00000589424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.82■■■■□ 3.16
USP36-216ENST00000589424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
USP36-216ENST00000589424 JPH4Q96JJ6 628 aa34.71■■■■□ 3.15
USP36-216ENST00000589424 CUL7Q14999 1698 aa34.66■■■■□ 3.14
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