RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616757.1

MME-217, Transcript of membrane metalloendopeptidase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MME, Length 1,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MME-217ENST00000616757 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.34■■■■■ 5.49
MME-217ENST00000616757 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.26■■■■■ 4.68
MME-217ENST00000616757 ABCC9O60706 1549 aa44.22■■■■■ 4.67
MME-217ENST00000616757 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.12■■■■■ 4.33
MME-217ENST00000616757 NACADO15069 1562 aa41.84■■■■■ 4.29
MME-217ENST00000616757 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.68■■■■■ 4.26
MME-217ENST00000616757 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.46■■■■■ 4.23
MME-217ENST00000616757 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.26■■■■■ 4.2
MME-217ENST00000616757 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.19■■■■■ 4.19
MME-217ENST00000616757 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.19
MME-217ENST00000616757 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
MME-217ENST00000616757 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.88■■■■■ 4.13
MME-217ENST00000616757 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.76■■■■■ 4.12
MME-217ENST00000616757 SCRIBQ14160 1630 aa40.33■■■■■ 4.05
MME-217ENST00000616757 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.33■■■■■ 4.05
MME-217ENST00000616757 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.96■■■■□ 3.99
MME-217ENST00000616757 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
MME-217ENST00000616757 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.83■■■■□ 3.97
MME-217ENST00000616757 NCAPD3P42695 1498 aa38.62■■■■□ 3.77
MME-217ENST00000616757 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.5■■■■□ 3.75
MME-217ENST00000616757 SMARCA4P51532 1647 aa38.48■■■■□ 3.75
MME-217ENST00000616757 SMARCA2P51531 1590 aa38.41■■■■□ 3.74
MME-217ENST00000616757 HMGXB3Q12766 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
MME-217ENST00000616757 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
MME-217ENST00000616757 ERCC6Q03468 1493 aa38.2■■■■□ 3.71
MME-217ENST00000616757 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
MME-217ENST00000616757 CUX2O14529 1486 aa38.1■■■■□ 3.69
MME-217ENST00000616757 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
MME-217ENST00000616757 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.06■■■■□ 3.68
MME-217ENST00000616757 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.02■■■■□ 3.68
MME-217ENST00000616757 NESP48681 1621 aa38.01■■■■□ 3.67
MME-217ENST00000616757 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.76■■■■□ 3.63
MME-217ENST00000616757 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
MME-217ENST00000616757 WIZO95785 1651 aa37.58■■■■□ 3.61
MME-217ENST00000616757 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.54■■■■□ 3.6
MME-217ENST00000616757 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.53■■■■□ 3.6
MME-217ENST00000616757 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.46■■■■□ 3.59
MME-217ENST00000616757 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
MME-217ENST00000616757 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.2■■■■□ 3.55
MME-217ENST00000616757 WDR62O43379 1518 aa37.1■■■■□ 3.53
MME-217ENST00000616757 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
MME-217ENST00000616757 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.06■■■■□ 3.52
MME-217ENST00000616757 CFTRP13569 1480 aa37.03■■■■□ 3.52
MME-217ENST00000616757 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.03■■■■□ 3.52
MME-217ENST00000616757 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
MME-217ENST00000616757 PRDM2Q13029 1718 aa36.69■■■■□ 3.46
MME-217ENST00000616757 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.68■■■■□ 3.46
MME-217ENST00000616757 TRIM41Q8WV44 630 aa36.41■■■■□ 3.42
MME-217ENST00000616757 OSCARQ8IYS5 282 aa36.4■■■■□ 3.42
MME-217ENST00000616757 TOPBP1Q92547 1522 aa36.33■■■■□ 3.41
MME-217ENST00000616757 IFT140Q96RY7 1462 aa36.32■■■■□ 3.41
MME-217ENST00000616757 ABCC8Q09428 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
MME-217ENST00000616757 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
MME-217ENST00000616757 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.2■■■■□ 3.39
MME-217ENST00000616757 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
MME-217ENST00000616757 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
MME-217ENST00000616757 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
MME-217ENST00000616757 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
MME-217ENST00000616757 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
MME-217ENST00000616757 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
MME-217ENST00000616757 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
MME-217ENST00000616757 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.83■■■■□ 3.33
MME-217ENST00000616757 SOGA1O94964 1423 aa35.82■■■■□ 3.32
MME-217ENST00000616757 CHD1O14646 1710 aa35.8■■■■□ 3.32
MME-217ENST00000616757 ARHGEF11O15085 1522 aa35.78■■■■□ 3.32
MME-217ENST00000616757 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
MME-217ENST00000616757 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.73■■■■□ 3.31
MME-217ENST00000616757 FBLN2P98095 1184 aa35.73■■■■□ 3.31
MME-217ENST00000616757 CUX1P39880 1505 aa35.71■■■■□ 3.31
MME-217ENST00000616757 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
MME-217ENST00000616757 WDR97A6NE52 1622 aa35.64■■■■□ 3.3
MME-217ENST00000616757 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.57■■■■□ 3.28
MME-217ENST00000616757 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.55■■■■□ 3.28
MME-217ENST00000616757 GRIN2BQ13224 1484 aa35.49■■■■□ 3.27
MME-217ENST00000616757 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
MME-217ENST00000616757 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
MME-217ENST00000616757 ARAP1Q96P48 1450 aa35.43■■■■□ 3.26
MME-217ENST00000616757 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.37■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 SYNJ1O43426 1573 aa35.37■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 SYNJ2O15056 1496 aa35.37■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 PBRM1Q86U86 1689 aa35.36■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.34■■■■□ 3.25
MME-217ENST00000616757 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.27■■■■□ 3.24
MME-217ENST00000616757 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
MME-217ENST00000616757 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.17■■■■□ 3.22
MME-217ENST00000616757 TOP2BQ02880 1626 aa35.16■■■■□ 3.22
MME-217ENST00000616757 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
MME-217ENST00000616757 GRIN2AQ12879 1464 aa35.03■■■■□ 3.2
MME-217ENST00000616757 ADAMTS12P58397 1594 aa35■■■■□ 3.19
MME-217ENST00000616757 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.93■■■■□ 3.18
MME-217ENST00000616757 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.9■■■■□ 3.18
MME-217ENST00000616757 CEP170Q5SW79 1584 aa34.9■■■■□ 3.18
MME-217ENST00000616757 NUP160Q12769 1436 aa34.9■■■■□ 3.18
MME-217ENST00000616757 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.83■■■■□ 3.17
MME-217ENST00000616757 SHROOM2Q13796 1616 aa34.75■■■■□ 3.15
MME-217ENST00000616757 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
MME-217ENST00000616757 JPH4Q96JJ6 628 aa34.58■■■■□ 3.13
MME-217ENST00000616757 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.51■■■■□ 3.11
MME-217ENST00000616757 KIF27Q86VH2 1401 aa34.48■■■■□ 3.11
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