Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 226.2■■□□□ 1.784e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PIEZO1-209ENST00000490756 446 ntTSL 321.93■■□□□ 1.14e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.364e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-201ENST00000318787 1350 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KARS-212ENST00000570215 994 ntTSL 315.24■□□□□ 0.034e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-209ENST00000609477 564 ntTSL 414.48□□□□□ -0.094e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-203ENST00000463370 2393 ntTSL 212.1□□□□□ -0.474e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KARS-207ENST00000566560 1231 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.634e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.661e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 410.66□□□□□ -0.74e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.861e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-201ENST00000265619 3596 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-206ENST00000520497 937 ntTSL 28.15□□□□□ -1.14e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCT5-204ENST00000503454 762 ntTSL 38.01□□□□□ -1.133e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VAPB-205ENST00000476395 3583 ntTSL 27.94□□□□□ -1.144e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KARS-203ENST00000562875 801 ntTSL 37.44□□□□□ -1.224e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 KARS-205ENST00000565738 607 ntTSL 27.22□□□□□ -1.254e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 KARS-206ENST00000566249 649 ntTSL 56.85□□□□□ -1.314e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CHD1-208ENST00000512392 1968 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KARS-210ENST00000568682 870 ntTSL 36.46□□□□□ -1.384e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-205ENST00000608456 624 ntTSL 36.07□□□□□ -1.444e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 KIF16B-204ENST00000450176 556 ntTSL 55.98□□□□□ -1.454e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PTPN12-209ENST00000460731 582 ntTSL 25.82□□□□□ -1.484e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IWS1-211ENST00000497888 592 ntTSL 25.2□□□□□ -1.581e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HDDC2-208ENST00000609021 3529 nt4.71□□□□□ -1.654e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CENPC-202ENST00000506410 692 ntTSL 24.71□□□□□ -1.661e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 53.45□□□□□ -1.861e-18■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ARID4B-204ENST00000418304 1759 ntTSL 516.22■□□□□ 0.199e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 EIF3D-210ENST00000462794 764 ntTSL 26.93□□□□□ -1.34e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 HNRNPUL1-218ENST00000601309 672 ntTSL 512.29□□□□□ -0.447e-9■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 222.33■■□□□ 1.175e-23■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 34.99□□□□□ -1.615e-23■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 511.18□□□□□ -0.623e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.753e-19■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 58.34□□□□□ -1.073e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.213e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.573e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 24.95□□□□□ -1.623e-19■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CAPRIN1-216ENST00000534042 574 ntTSL 518.35■□□□□ 0.532e-9■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CAPRIN1-208ENST00000530008 580 ntTSL 46.82□□□□□ -1.322e-9■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-211ENST00000527749 771 ntTSL 527.56■■■□□ 23e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.73e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CMPK1-202ENST00000371871 1212 ntTSL 224.27■■□□□ 1.483e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PKN1-210ENST00000587429 562 ntTSL 422.69■■□□□ 1.227e-10■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 CMPK1-201ENST00000371870 812 ntTSL 220.3■□□□□ 0.843e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PKN1-212ENST00000590097 848 ntTSL 320.11■□□□□ 0.817e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PKN1-203ENST00000585619 582 ntTSL 520.11■□□□□ 0.817e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 319.94■□□□□ 0.783e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-224ENST00000534305 666 ntTSL 318.9■□□□□ 0.623e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-215ENST00000529389 992 ntTSL 318.13■□□□□ 0.493e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PPAN-206ENST00000466025 523 ntTSL 217.99■□□□□ 0.473e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-8■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PKN1-214ENST00000592794 322 ntTSL 417.82■□□□□ 0.447e-10■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SRRT-212ENST00000487311 563 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-7■□□□□ 9.7
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PUM1Q14671 RELA-218ENST00000532776 602 ntTSL 217.35■□□□□ 0.373e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 317.11■□□□□ 0.333e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-212ENST00000433104 2490 ntTSL 216.76■□□□□ 0.273e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PDHA1-205ENST00000417819 471 ntTSL 316.75■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CNOT3-207ENST00000496327 784 ntTSL 516.68■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-213ENST00000527909 591 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-216ENST00000531238 541 ntTSL 416.49■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-222ENST00000533546 569 ntTSL 416.49■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SART1-208ENST00000533386 586 ntTSL 216.22■□□□□ 0.193e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 SART1-205ENST00000529580 390 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-203ENST00000412795 750 ntTSL 315.98■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 LASP1-206ENST00000579123 1874 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 515.62■□□□□ 0.092e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 ERICH1-204ENST00000518895 585 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-8■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 415.3■□□□□ 0.043e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-11■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CLPTM1-208ENST00000588274 805 ntTSL 215.23■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 RELA-204ENST00000525658 808 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.7
PUM1Q14671 CACTIN-206ENST00000588749 391 ntTSL 314.92□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.7
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