Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX21Q969T3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms