RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639169.1

GCSH-208, Transcript of glycine cleavage system protein H, human

TSL 2 BASIC

Gene GCSH, Length 2,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCSH-208	ENST00000639169	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.81	■■■■□ 3.96
GCSH-208	ENST00000639169	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.07	■■■■□ 3.04
GCSH-208	ENST00000639169	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GCSH-208	ENST00000639169	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
GCSH-208	ENST00000639169	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GCSH-208	ENST00000639169	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GCSH-208	ENST00000639169	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
GCSH-208	ENST00000639169	ABCC9	O60706	1549 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GCSH-208	ENST00000639169	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GCSH-208	ENST00000639169	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.89	■■■□□ 2.7
GCSH-208	ENST00000639169	NACAD	O15069	1562 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GCSH-208	ENST00000639169	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.35	■■■□□ 2.61
GCSH-208	ENST00000639169	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GCSH-208	ENST00000639169	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
GCSH-208	ENST00000639169	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GCSH-208	ENST00000639169	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.96	■■■□□ 2.55
GCSH-208	ENST00000639169	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		30.87	■■■□□ 2.53
GCSH-208	ENST00000639169	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	30.75	■■■□□ 2.51
GCSH-208	ENST00000639169	WIZ	O95785	1651 aa		30.75	■■■□□ 2.51
GCSH-208	ENST00000639169	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.58	■■■□□ 2.49
GCSH-208	ENST00000639169	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		30.54	■■■□□ 2.48
GCSH-208	ENST00000639169	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.46	■■■□□ 2.47
GCSH-208	ENST00000639169	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.44	■■■□□ 2.46
GCSH-208	ENST00000639169	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.36	■■■□□ 2.45
GCSH-208	ENST00000639169	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.2	■■■□□ 2.42
GCSH-208	ENST00000639169	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.15	■■■□□ 2.42
GCSH-208	ENST00000639169	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GCSH-208	ENST00000639169	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.04	■■■□□ 2.4
GCSH-208	ENST00000639169	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
GCSH-208	ENST00000639169	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.95	■■■□□ 2.39
GCSH-208	ENST00000639169	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GCSH-208	ENST00000639169	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GCSH-208	ENST00000639169	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.84	■■■□□ 2.37
GCSH-208	ENST00000639169	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GCSH-208	ENST00000639169	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
GCSH-208	ENST00000639169	SOGA1	O94964	1423 aa		29.45	■■■□□ 2.3
GCSH-208	ENST00000639169	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.37	■■■□□ 2.29
GCSH-208	ENST00000639169	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GCSH-208	ENST00000639169	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GCSH-208	ENST00000639169	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GCSH-208	ENST00000639169	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GCSH-208	ENST00000639169	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
GCSH-208	ENST00000639169	HRC	P23327	699 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GCSH-208	ENST00000639169	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.19	■■■□□ 2.26
GCSH-208	ENST00000639169	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
GCSH-208	ENST00000639169	EEA1	Q15075	1411 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GCSH-208	ENST00000639169	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.24
GCSH-208	ENST00000639169	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		28.99	■■■□□ 2.23
GCSH-208	ENST00000639169	CFTR	P13569	1480 aa		28.95	■■■□□ 2.22
GCSH-208	ENST00000639169	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.94	■■■□□ 2.22
GCSH-208	ENST00000639169	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GCSH-208	ENST00000639169	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GCSH-208	ENST00000639169	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GCSH-208	ENST00000639169	CUX1	P39880	1505 aa		28.85	■■■□□ 2.21
GCSH-208	ENST00000639169	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.82	■■■□□ 2.2
GCSH-208	ENST00000639169	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
GCSH-208	ENST00000639169	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		28.76	■■■□□ 2.2
GCSH-208	ENST00000639169	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.76	■■■□□ 2.19
GCSH-208	ENST00000639169	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GCSH-208	ENST00000639169	KIF21B	O75037	1637 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GCSH-208	ENST00000639169	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GCSH-208	ENST00000639169	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		28.63	■■■□□ 2.17
GCSH-208	ENST00000639169	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.59	■■■□□ 2.17
GCSH-208	ENST00000639169	NES	P48681	1621 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GCSH-208	ENST00000639169	CLIP1	P30622	1438 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GCSH-208	ENST00000639169	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GCSH-208	ENST00000639169	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GCSH-208	ENST00000639169	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GCSH-208	ENST00000639169	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GCSH-208	ENST00000639169	CUX2	O14529	1486 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GCSH-208	ENST00000639169	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GCSH-208	ENST00000639169	IGF1R	P08069	1367 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GCSH-208	ENST00000639169	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GCSH-208	ENST00000639169	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GCSH-208	ENST00000639169	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GCSH-208	ENST00000639169	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GCSH-208	ENST00000639169	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	APLP2	Q06481	763 aa		28.14	■■■□□ 2.1
GCSH-208	ENST00000639169	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GCSH-208	ENST00000639169	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
GCSH-208	ENST00000639169	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GCSH-208	ENST00000639169	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GCSH-208	ENST00000639169	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GCSH-208	ENST00000639169	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GCSH-208	ENST00000639169	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GCSH-208	ENST00000639169	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GCSH-208	ENST00000639169	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GCSH-208	ENST00000639169	P3H3	Q8IVL6	736 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GCSH-208	ENST00000639169	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.82	■■■□□ 2.04
GCSH-208	ENST00000639169	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GCSH-208	ENST00000639169	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GCSH-208	ENST00000639169	CUL7	Q14999	1698 aa		27.72	■■■□□ 2.03
GCSH-208	ENST00000639169	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GCSH-208	ENST00000639169	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GCSH-208	ENST00000639169	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02

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