RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565772.5

FAM219B-212, Transcript of family with sequence similarity 219 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM219B, Length 1,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM219B-212ENST00000565772 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.27■■■■■ 5.64
FAM219B-212ENST00000565772 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.03■■■■■ 4.8
FAM219B-212ENST00000565772 ABCC9O60706 1549 aa44.56■■■■■ 4.72
FAM219B-212ENST00000565772 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.67■■■■■ 4.42
FAM219B-212ENST00000565772 NACADO15069 1562 aa42.48■■■■■ 4.39
FAM219B-212ENST00000565772 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.22■■■■■ 4.35
FAM219B-212ENST00000565772 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
FAM219B-212ENST00000565772 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
FAM219B-212ENST00000565772 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.65■■■■■ 4.26
FAM219B-212ENST00000565772 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.61■■■■■ 4.25
FAM219B-212ENST00000565772 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.51■■■■■ 4.24
FAM219B-212ENST00000565772 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.42■■■■■ 4.22
FAM219B-212ENST00000565772 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.33■■■■■ 4.21
FAM219B-212ENST00000565772 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
FAM219B-212ENST00000565772 SCRIBQ14160 1630 aa40.95■■■■■ 4.15
FAM219B-212ENST00000565772 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
FAM219B-212ENST00000565772 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.31■■■■■ 4.04
FAM219B-212ENST00000565772 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM219B-212ENST00000565772 NCAPD3P42695 1498 aa39.17■■■■□ 3.86
FAM219B-212ENST00000565772 SMARCA4P51532 1647 aa39.14■■■■□ 3.86
FAM219B-212ENST00000565772 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
FAM219B-212ENST00000565772 SMARCA2P51531 1590 aa39.04■■■■□ 3.84
FAM219B-212ENST00000565772 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
FAM219B-212ENST00000565772 HMGXB3Q12766 1538 aa38.94■■■■□ 3.82
FAM219B-212ENST00000565772 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.8■■■■□ 3.8
FAM219B-212ENST00000565772 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
FAM219B-212ENST00000565772 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.69■■■■□ 3.78
FAM219B-212ENST00000565772 ERCC6Q03468 1493 aa38.51■■■■□ 3.76
FAM219B-212ENST00000565772 NESP48681 1621 aa38.36■■■■□ 3.73
FAM219B-212ENST00000565772 CUX2O14529 1486 aa38.35■■■■□ 3.73
FAM219B-212ENST00000565772 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.27■■■■□ 3.72
FAM219B-212ENST00000565772 WIZO95785 1651 aa38.25■■■■□ 3.71
FAM219B-212ENST00000565772 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
FAM219B-212ENST00000565772 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.04■■■■□ 3.68
FAM219B-212ENST00000565772 CADPSQ9ULU8 1353 aa38■■■■□ 3.67
FAM219B-212ENST00000565772 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
FAM219B-212ENST00000565772 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.93■■■■□ 3.66
FAM219B-212ENST00000565772 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.88■■■■□ 3.65
FAM219B-212ENST00000565772 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
FAM219B-212ENST00000565772 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.65■■■■□ 3.62
FAM219B-212ENST00000565772 CFTRP13569 1480 aa37.64■■■■□ 3.62
FAM219B-212ENST00000565772 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.58■■■■□ 3.61
FAM219B-212ENST00000565772 WDR62O43379 1518 aa37.56■■■■□ 3.6
FAM219B-212ENST00000565772 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.55■■■■□ 3.6
FAM219B-212ENST00000565772 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.38■■■■□ 3.57
FAM219B-212ENST00000565772 PRDM2Q13029 1718 aa37.34■■■■□ 3.57
FAM219B-212ENST00000565772 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
FAM219B-212ENST00000565772 ABCC8Q09428 1581 aa36.91■■■■□ 3.5
FAM219B-212ENST00000565772 TOPBP1Q92547 1522 aa36.88■■■■□ 3.49
FAM219B-212ENST00000565772 IFT140Q96RY7 1462 aa36.83■■■■□ 3.49
FAM219B-212ENST00000565772 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.8■■■■□ 3.48
FAM219B-212ENST00000565772 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
FAM219B-212ENST00000565772 OSCARQ8IYS5 282 aa36.64■■■■□ 3.46
FAM219B-212ENST00000565772 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
FAM219B-212ENST00000565772 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
FAM219B-212ENST00000565772 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
FAM219B-212ENST00000565772 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
FAM219B-212ENST00000565772 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.411e-6■■■■□ 23.5
FAM219B-212ENST00000565772 SOGA1O94964 1423 aa36.37■■■■□ 3.41
FAM219B-212ENST00000565772 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.34■■■■□ 3.41
FAM219B-212ENST00000565772 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.34■■■■□ 3.41
FAM219B-212ENST00000565772 CUX1P39880 1505 aa36.34■■■■□ 3.41
FAM219B-212ENST00000565772 TRIM41Q8WV44 630 aa36.32■■■■□ 3.4
FAM219B-212ENST00000565772 WDR97A6NE52 1622 aa36.28■■■■□ 3.4
FAM219B-212ENST00000565772 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
FAM219B-212ENST00000565772 CHD1O14646 1710 aa36.18■■■■□ 3.38
FAM219B-212ENST00000565772 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
FAM219B-212ENST00000565772 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
FAM219B-212ENST00000565772 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.09■■■■□ 3.37
FAM219B-212ENST00000565772 FBLN2P98095 1184 aa36.08■■■■□ 3.37
FAM219B-212ENST00000565772 GRIN2BQ13224 1484 aa36.04■■■■□ 3.36
FAM219B-212ENST00000565772 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.04■■■■□ 3.36
FAM219B-212ENST00000565772 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
FAM219B-212ENST00000565772 ARHGEF11O15085 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
FAM219B-212ENST00000565772 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.98■■■■□ 3.35
FAM219B-212ENST00000565772 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.94■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 PBRM1Q86U86 1689 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 TOP2BQ02880 1626 aa35.9■■■■□ 3.34
FAM219B-212ENST00000565772 SYNJ2O15056 1496 aa35.88■■■■□ 3.33
FAM219B-212ENST00000565772 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.88■■■■□ 3.33
FAM219B-212ENST00000565772 SYNJ1O43426 1573 aa35.84■■■■□ 3.33
FAM219B-212ENST00000565772 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.78■■■■□ 3.32
FAM219B-212ENST00000565772 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.71■■■■□ 3.31
FAM219B-212ENST00000565772 ARAP1Q96P48 1450 aa35.67■■■■□ 3.3
FAM219B-212ENST00000565772 ADAMTS12P58397 1594 aa35.58■■■■□ 3.29
FAM219B-212ENST00000565772 GRIN2AQ12879 1464 aa35.55■■■■□ 3.28
FAM219B-212ENST00000565772 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.55■■■■□ 3.28
FAM219B-212ENST00000565772 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.52■■■■□ 3.28
FAM219B-212ENST00000565772 NUP160Q12769 1436 aa35.42■■■■□ 3.26
FAM219B-212ENST00000565772 CEP170Q5SW79 1584 aa35.38■■■■□ 3.25
FAM219B-212ENST00000565772 SHROOM2Q13796 1616 aa35.24■■■■□ 3.23
FAM219B-212ENST00000565772 KIF27Q86VH2 1401 aa35.23■■■■□ 3.23
FAM219B-212ENST00000565772 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
FAM219B-212ENST00000565772 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.17■■■■□ 3.22
FAM219B-212ENST00000565772 IGF1RP08069 1367 aa35.13■■■■□ 3.21
FAM219B-212ENST00000565772 CUL7Q14999 1698 aa35.12■■■■□ 3.21
FAM219B-212ENST00000565772 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms