RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237696.9

RARRES1-201, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-201ENST00000237696 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.71■■■■■ 4.27
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RARRES1-201ENST00000237696 ABCC9O60706 1549 aa34.54■■■■□ 3.12
RARRES1-201ENST00000237696 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.39■■■■□ 3.1
RARRES1-201ENST00000237696 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.31■■■■□ 3.08
RARRES1-201ENST00000237696 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.85■■■■□ 3.01
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RARRES1-201ENST00000237696 SCRIBQ14160 1630 aa33.56■■■□□ 2.96
RARRES1-201ENST00000237696 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.49■■■□□ 2.95
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RARRES1-201ENST00000237696 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.57■■■□□ 2.8
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RARRES1-201ENST00000237696 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.33■■■□□ 2.77
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RARRES1-201ENST00000237696 SMARCA4P51532 1647 aa32.05■■■□□ 2.72
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RARRES1-201ENST00000237696 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.57■■■□□ 2.64
RARRES1-201ENST00000237696 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.55■■■□□ 2.64
RARRES1-201ENST00000237696 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.55■■■□□ 2.64
RARRES1-201ENST00000237696 SMARCA2P51531 1590 aa31.43■■■□□ 2.62
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RARRES1-201ENST00000237696 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.14■■■□□ 2.58
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RARRES1-201ENST00000237696 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.52■■■□□ 2.48
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RARRES1-201ENST00000237696 SYNJ1O43426 1573 aa30.42■■■□□ 2.46
RARRES1-201ENST00000237696 NESP48681 1621 aa30.35■■■□□ 2.45
RARRES1-201ENST00000237696 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.32■■■□□ 2.44
RARRES1-201ENST00000237696 PRDM2Q13029 1718 aa30.27■■■□□ 2.44
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RARRES1-201ENST00000237696 TOP2BQ02880 1626 aa30.19■■■□□ 2.42
RARRES1-201ENST00000237696 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.19■■■□□ 2.42
RARRES1-201ENST00000237696 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.17■■■□□ 2.42
RARRES1-201ENST00000237696 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.13■■■□□ 2.41
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RARRES1-201ENST00000237696 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.93■■■□□ 2.38
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RARRES1-201ENST00000237696 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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RARRES1-201ENST00000237696 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
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RARRES1-201ENST00000237696 KIF21BO75037 1637 aa29.6■■■□□ 2.33
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RARRES1-201ENST00000237696 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.37■■■□□ 2.29
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RARRES1-201ENST00000237696 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.23■■■□□ 2.27
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RARRES1-201ENST00000237696 PBRM1Q86U86 1689 aa29.06■■■□□ 2.24
RARRES1-201ENST00000237696 GRIN2BQ13224 1484 aa29■■■□□ 2.23
RARRES1-201ENST00000237696 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
RARRES1-201ENST00000237696 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
RARRES1-201ENST00000237696 ARAP1Q96P48 1450 aa28.96■■■□□ 2.23
RARRES1-201ENST00000237696 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RARRES1-201ENST00000237696 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.93■■■□□ 2.22
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