RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368160.7

CD1E-205, Transcript of CD1e molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD1E, Length 1,727 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1E-205ENST00000368160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.22■■■■■ 4.19
CD1E-205ENST00000368160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.33■■■■□ 3.41
CD1E-205ENST00000368160 ABCC9O60706 1549 aa34.77■■■■□ 3.16
CD1E-205ENST00000368160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CD1E-205ENST00000368160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.17■■■■□ 3.06
CD1E-205ENST00000368160 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.03■■■■□ 3.04
CD1E-205ENST00000368160 NACADO15069 1562 aa33.94■■■■□ 3.02
CD1E-205ENST00000368160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.9■■■■□ 3.02
CD1E-205ENST00000368160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.76■■■■□ 3
CD1E-205ENST00000368160 SCRIBQ14160 1630 aa33.18■■■□□ 2.9
CD1E-205ENST00000368160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.16■■■□□ 2.9
CD1E-205ENST00000368160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.11■■■□□ 2.89
CD1E-205ENST00000368160 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.87■■■□□ 2.85
CD1E-205ENST00000368160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
CD1E-205ENST00000368160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CD1E-205ENST00000368160 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.05■■■□□ 2.72
CD1E-205ENST00000368160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CD1E-205ENST00000368160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
CD1E-205ENST00000368160 SMARCA4P51532 1647 aa31.84■■■□□ 2.69
CD1E-205ENST00000368160 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
CD1E-205ENST00000368160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CD1E-205ENST00000368160 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.56■■■□□ 2.64
CD1E-205ENST00000368160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.54■■■□□ 2.64
CD1E-205ENST00000368160 WIZO95785 1651 aa31.5■■■□□ 2.63
CD1E-205ENST00000368160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.46■■■□□ 2.63
CD1E-205ENST00000368160 SMARCA2P51531 1590 aa31.42■■■□□ 2.62
CD1E-205ENST00000368160 NCAPD3P42695 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
CD1E-205ENST00000368160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.32■■■□□ 2.6
CD1E-205ENST00000368160 HMGXB3Q12766 1538 aa31.26■■■□□ 2.59
CD1E-205ENST00000368160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
CD1E-205ENST00000368160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CD1E-205ENST00000368160 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.11■■■□□ 2.57
CD1E-205ENST00000368160 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.81■■■□□ 2.52
CD1E-205ENST00000368160 CFTRP13569 1480 aa30.44■■■□□ 2.46
CD1E-205ENST00000368160 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.41■■■□□ 2.46
CD1E-205ENST00000368160 NESP48681 1621 aa30.37■■■□□ 2.45
CD1E-205ENST00000368160 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.36■■■□□ 2.45
CD1E-205ENST00000368160 TRIM41Q8WV44 630 aa30.32■■■□□ 2.44
CD1E-205ENST00000368160 PRDM2Q13029 1718 aa30.3■■■□□ 2.44
CD1E-205ENST00000368160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.07■■■□□ 2.4
CD1E-205ENST00000368160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.06■■■□□ 2.4
CD1E-205ENST00000368160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.05■■■□□ 2.4
CD1E-205ENST00000368160 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.94■■■□□ 2.38
CD1E-205ENST00000368160 ABCC8Q09428 1581 aa29.92■■■□□ 2.38
CD1E-205ENST00000368160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.84■■■□□ 2.37
CD1E-205ENST00000368160 ERCC6Q03468 1493 aa29.82■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 CUX1P39880 1505 aa29.8■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 SYNJ1O43426 1573 aa29.78■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CD1E-205ENST00000368160 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.76■■■□□ 2.35
CD1E-205ENST00000368160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.73■■■□□ 2.35
CD1E-205ENST00000368160 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.73■■■□□ 2.35
CD1E-205ENST00000368160 TOP2BQ02880 1626 aa29.72■■■□□ 2.35
CD1E-205ENST00000368160 TOPBP1Q92547 1522 aa29.7■■■□□ 2.34
CD1E-205ENST00000368160 WDR62O43379 1518 aa29.69■■■□□ 2.34
CD1E-205ENST00000368160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
CD1E-205ENST00000368160 EEA1Q15075 1411 aa29.62■■■□□ 2.33
CD1E-205ENST00000368160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
CD1E-205ENST00000368160 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CD1E-205ENST00000368160 CUX2O14529 1486 aa29.45■■■□□ 2.3
CD1E-205ENST00000368160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.29
CD1E-205ENST00000368160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.36■■■□□ 2.29
CD1E-205ENST00000368160 SOGA1O94964 1423 aa29.36■■■□□ 2.29
CD1E-205ENST00000368160 WDR97A6NE52 1622 aa29.34■■■□□ 2.29
CD1E-205ENST00000368160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.3■■■□□ 2.28
CD1E-205ENST00000368160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.29■■■□□ 2.28
CD1E-205ENST00000368160 IFT140Q96RY7 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
CD1E-205ENST00000368160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.16■■■□□ 2.26
CD1E-205ENST00000368160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CD1E-205ENST00000368160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.16■■■□□ 2.26
CD1E-205ENST00000368160 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.16■■■□□ 2.26
CD1E-205ENST00000368160 GOLGA3Q08378 1498 aa29.14■■■□□ 2.26
CD1E-205ENST00000368160 KIF21BO75037 1637 aa29.11■■■□□ 2.25
CD1E-205ENST00000368160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.1■■■□□ 2.25
CD1E-205ENST00000368160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CD1E-205ENST00000368160 KIF27Q86VH2 1401 aa29.09■■■□□ 2.25
CD1E-205ENST00000368160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CD1E-205ENST00000368160 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CD1E-205ENST00000368160 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.06■■■□□ 2.24
CD1E-205ENST00000368160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
CD1E-205ENST00000368160 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.03■■■□□ 2.24
CD1E-205ENST00000368160 PBRM1Q86U86 1689 aa28.98■■■□□ 2.23
CD1E-205ENST00000368160 CEP162Q5TB80 1403 aa28.97■■■□□ 2.23
CD1E-205ENST00000368160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CD1E-205ENST00000368160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
CD1E-205ENST00000368160 IGF1RP08069 1367 aa28.94■■■□□ 2.22
CD1E-205ENST00000368160 GRIN2BQ13224 1484 aa28.91■■■□□ 2.22
CD1E-205ENST00000368160 PRXQ9BXM0 1461 aa28.81■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 CUL7Q14999 1698 aa28.81■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 ADAMTS12P58397 1594 aa28.8■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.79■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.76■■■□□ 2.2
CD1E-205ENST00000368160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.73■■■□□ 2.19
CD1E-205ENST00000368160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.71■■■□□ 2.19
CD1E-205ENST00000368160 HRCP23327 699 aa28.69■■■□□ 2.18
CD1E-205ENST00000368160 CLIP1P30622 1438 aa28.66■■■□□ 2.18
CD1E-205ENST00000368160 SYNJ2O15056 1496 aa28.66■■■□□ 2.18
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