RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376573.8

PIP4K2A-202, Transcript of phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase type 2 alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PIP4K2A, Length 3,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2A-202ENST00000376573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.27■■■■□ 3.4
PIP4K2A-202ENST00000376573 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.64■■■□□ 2.98
PIP4K2A-202ENST00000376573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.32■■■□□ 2.92
PIP4K2A-202ENST00000376573 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
PIP4K2A-202ENST00000376573 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.38■■■□□ 2.61
PIP4K2A-202ENST00000376573 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
PIP4K2A-202ENST00000376573 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2A-202ENST00000376573 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.69■■■□□ 2.5
PIP4K2A-202ENST00000376573 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.54■■■□□ 2.48
PIP4K2A-202ENST00000376573 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PIP4K2A-202ENST00000376573 TRIM41Q8WV44 630 aa30.25■■■□□ 2.43
PIP4K2A-202ENST00000376573 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
PIP4K2A-202ENST00000376573 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PIP4K2A-202ENST00000376573 ABCC9O60706 1549 aa30.08■■■□□ 2.41
PIP4K2A-202ENST00000376573 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.84■■■□□ 2.37
PIP4K2A-202ENST00000376573 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.82■■■□□ 2.36
PIP4K2A-202ENST00000376573 HRCP23327 699 aa29.71■■■□□ 2.35
PIP4K2A-202ENST00000376573 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
PIP4K2A-202ENST00000376573 SCRIBQ14160 1630 aa29.57■■■□□ 2.32
PIP4K2A-202ENST00000376573 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.32
PIP4K2A-202ENST00000376573 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2A-202ENST00000376573 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PIP4K2A-202ENST00000376573 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2A-202ENST00000376573 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PIP4K2A-202ENST00000376573 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2A-202ENST00000376573 APLP2Q06481 763 aa28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2A-202ENST00000376573 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2A-202ENST00000376573 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.78■■■□□ 2.2
PIP4K2A-202ENST00000376573 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PIP4K2A-202ENST00000376573 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PIP4K2A-202ENST00000376573 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.61■■■□□ 2.17
PIP4K2A-202ENST00000376573 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PIP4K2A-202ENST00000376573 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.47■■■□□ 2.15
PIP4K2A-202ENST00000376573 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2A-202ENST00000376573 ITGAEP38570 1179 aa28.42■■■□□ 2.14
PIP4K2A-202ENST00000376573 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.37■■■□□ 2.13
PIP4K2A-202ENST00000376573 NACADO15069 1562 aa28.31■■■□□ 2.12
PIP4K2A-202ENST00000376573 WIZO95785 1651 aa28.19■■■□□ 2.1
PIP4K2A-202ENST00000376573 ABCC8Q09428 1581 aa28.07■■■□□ 2.08
PIP4K2A-202ENST00000376573 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2A-202ENST00000376573 SOGA1O94964 1423 aa28.03■■■□□ 2.08
PIP4K2A-202ENST00000376573 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2A-202ENST00000376573 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2A-202ENST00000376573 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2A-202ENST00000376573 P3H3Q8IVL6 736 aa27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2A-202ENST00000376573 CEP162Q5TB80 1403 aa27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2A-202ENST00000376573 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2A-202ENST00000376573 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2A-202ENST00000376573 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2A-202ENST00000376573 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PIP4K2A-202ENST00000376573 CLIP1P30622 1438 aa27.58■■■□□ 2.01
PIP4K2A-202ENST00000376573 ARID3CA6NKF2 412 aa27.54■■■□□ 2
PIP4K2A-202ENST00000376573 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.54■■■□□ 2
PIP4K2A-202ENST00000376573 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PIP4K2A-202ENST00000376573 NEUROD1Q13562 356 aa27.53■■■□□ 2
PIP4K2A-202ENST00000376573 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.52■■■□□ 2
PIP4K2A-202ENST00000376573 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2A-202ENST00000376573 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2A-202ENST00000376573 GOLGA3Q08378 1498 aa27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2A-202ENST00000376573 SMARCA4P51532 1647 aa27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2A-202ENST00000376573 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2A-202ENST00000376573 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2A-202ENST00000376573 SMARCA2P51531 1590 aa27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2A-202ENST00000376573 EEA1Q15075 1411 aa27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2A-202ENST00000376573 MIER1Q8N108 512 aa27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2A-202ENST00000376573 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2A-202ENST00000376573 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2A-202ENST00000376573 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2A-202ENST00000376573 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2A-202ENST00000376573 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2A-202ENST00000376573 FBLN2P98095 1184 aa27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2A-202ENST00000376573 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2A-202ENST00000376573 TRIM52Q96A61 297 aa27.02■■□□□ 1.92
PIP4K2A-202ENST00000376573 KIF27Q86VH2 1401 aa27.01■■□□□ 1.91
PIP4K2A-202ENST00000376573 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.98■■□□□ 1.91
PIP4K2A-202ENST00000376573 BCANQ96GW7 911 aa26.97■■□□□ 1.91
PIP4K2A-202ENST00000376573 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.95■■□□□ 1.91
PIP4K2A-202ENST00000376573 CUX2O14529 1486 aa26.93■■□□□ 1.9
PIP4K2A-202ENST00000376573 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PIP4K2A-202ENST00000376573 SYNJ1O43426 1573 aa26.89■■□□□ 1.89
PIP4K2A-202ENST00000376573 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.88■■□□□ 1.89
PIP4K2A-202ENST00000376573 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PIP4K2A-202ENST00000376573 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.85■■□□□ 1.89
PIP4K2A-202ENST00000376573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.78■■□□□ 1.88
PIP4K2A-202ENST00000376573 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PIP4K2A-202ENST00000376573 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.73■■□□□ 1.87
PIP4K2A-202ENST00000376573 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PIP4K2A-202ENST00000376573 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.71■■□□□ 1.87
PIP4K2A-202ENST00000376573 NEFLP07196 543 aa26.7■■□□□ 1.86
PIP4K2A-202ENST00000376573 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.68■■□□□ 1.86
PIP4K2A-202ENST00000376573 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2A-202ENST00000376573 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PIP4K2A-202ENST00000376573 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.59■■□□□ 1.85
PIP4K2A-202ENST00000376573 ANP32CO43423 234 aa26.55■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 KIF21BO75037 1637 aa26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.54■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 TONSLQ96HA7 1378 aa26.53■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.51■■□□□ 1.84
PIP4K2A-202ENST00000376573 IGF1RP08069 1367 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms