Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 222.22■■□□□ 1.152e-14■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-205ENST00000506587 1971 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-203ENST00000504780 605 ntTSL 37.15□□□□□ -1.262e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.292e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.063e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.063e-7■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL36-207ENST00000582463 239 ntTSL 524.29■■□□□ 1.488e-62■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 QSOX1-204ENST00000443059 893 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 311.72□□□□□ -0.535e-16■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 224■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.295e-11■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CCDC58-201ENST00000291458 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.535e-11■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-11■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CCDC58-202ENST00000460810 573 ntTSL 25.32□□□□□ -1.565e-11■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CCDC58-203ENST00000466854 769 ntTSL 35.12□□□□□ -1.595e-11■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CLPTM1-205ENST00000586915 775 ntTSL 220.56■□□□□ 0.886e-17■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-17■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-214ENST00000602970 572 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-211ENST00000602837 814 ntTSL 38.44□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 ARF5-205ENST00000467281 567 ntTSL 424.98■■□□□ 1.591e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-211ENST00000529503 878 ntTSL 524.29■■□□□ 1.481e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-207ENST00000526341 557 ntTSL 524.29■■□□□ 1.481e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-210ENST00000528073 986 ntTSL 324.27■■□□□ 1.481e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-213ENST00000530258 535 ntTSL 424.07■■□□□ 1.441e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-214ENST00000530633 835 ntTSL 323.96■■□□□ 1.431e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-217ENST00000532758 1079 ntTSL 323.95■■□□□ 1.421e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-204ENST00000525087 937 ntTSL 523.95■■□□□ 1.421e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 ARF5-206ENST00000489673 566 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 NOP53-211ENST00000600266 666 ntTSL 220.42■□□□□ 0.861e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.771e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 GPAA1-203ENST00000524418 825 ntTSL 319.61■□□□□ 0.731e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 ARF5-202ENST00000415666 546 ntTSL 513.93□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 ARF5-203ENST00000459680 466 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.511e-8■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.271e-33■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-33■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 515.65■□□□□ 0.11e-33■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.221e-33■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.061e-33■■■■□ 19.3
PABPC4Q13310 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.473e-12■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 TMEM219-208ENST00000575829 721 ntTSL 515.84■□□□□ 0.133e-12■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.748e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.688e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 323.67■■□□□ 1.388e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 223.67■■□□□ 1.388e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 525.63■■□□□ 1.691e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.511e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 221.65■■□□□ 1.061e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-204ENST00000587500 540 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 219.03■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-212ENST00000592531 370 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 QTRT1-211ENST00000592376 500 ntTSL 313.43□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.778e-11■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-11■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-210ENST00000491313 1919 ntTSL 217.6■□□□□ 0.412e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-207ENST00000479481 3271 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.572e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 UBE2B-203ENST00000503080 657 ntTSL 26.15□□□□□ -1.425e-10■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RPL11-203ENST00000458455 721 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.053e-42■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MIF-203ENST00000498385 435 ntTSL 224.09■■□□□ 1.456e-27■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-34■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-34■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-34■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-34■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.634e-13■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-203ENST00000465532 791 ntTSL 211.5□□□□□ -0.573e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-207ENST00000495344 606 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-206ENST00000478613 716 ntTSL 27.67□□□□□ -1.183e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-204ENST00000469658 437 ntTSL 26.45□□□□□ -1.383e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.383e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.383e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.963e-8■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.472e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.662e-20■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.392e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.252e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-204ENST00000525066 1545 ntTSL 527.21■■□□□ 1.952e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 19.2
PABPC4Q13310 RAD51-202ENST00000382643 1588 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 19.2
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