RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525066.5

RAD51-204, Transcript of RAD51 recombinase, humanhuman

TSL 5

Gene RAD51, Length 1,545 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51-204ENST00000525066 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.66■■■■■ 6.5
RAD51-204ENST00000525066 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.42■■■■■ 5.5
RAD51-204ENST00000525066 ABCC9O60706 1549 aa48.32■■■■■ 5.33
RAD51-204ENST00000525066 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.47■■■■■ 5.03
RAD51-204ENST00000525066 NACADO15069 1562 aa46.43■■■■■ 5.02
RAD51-204ENST00000525066 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.43■■■■■ 5.02
RAD51-204ENST00000525066 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
RAD51-204ENST00000525066 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.18■■■■■ 4.98
RAD51-204ENST00000525066 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.03■■■■■ 4.96
RAD51-204ENST00000525066 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.48■■■■■ 4.87
RAD51-204ENST00000525066 SCRIBQ14160 1630 aa45.16■■■■■ 4.82
RAD51-204ENST00000525066 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.16■■■■■ 4.82
RAD51-204ENST00000525066 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.12■■■■■ 4.81
RAD51-204ENST00000525066 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.56■■■■■ 4.72
RAD51-204ENST00000525066 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.28■■■■■ 4.68
RAD51-204ENST00000525066 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
RAD51-204ENST00000525066 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.7■■■■■ 4.59
RAD51-204ENST00000525066 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.4■■■■■ 4.54
RAD51-204ENST00000525066 SMARCA4P51532 1647 aa43.18■■■■■ 4.5
RAD51-204ENST00000525066 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
RAD51-204ENST00000525066 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.94■■■■■ 4.46
RAD51-204ENST00000525066 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.92■■■■■ 4.46
RAD51-204ENST00000525066 NCAPD3P42695 1498 aa42.85■■■■■ 4.45
RAD51-204ENST00000525066 SMARCA2P51531 1590 aa42.84■■■■■ 4.45
RAD51-204ENST00000525066 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.75■■■■■ 4.43
RAD51-204ENST00000525066 HMGXB3Q12766 1538 aa42.67■■■■■ 4.42
RAD51-204ENST00000525066 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
RAD51-204ENST00000525066 WIZO95785 1651 aa42.48■■■■■ 4.39
RAD51-204ENST00000525066 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
RAD51-204ENST00000525066 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
RAD51-204ENST00000525066 NESP48681 1621 aa41.86■■■■■ 4.29
RAD51-204ENST00000525066 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.71■■■■■ 4.27
RAD51-204ENST00000525066 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.61■■■■■ 4.25
RAD51-204ENST00000525066 ERCC6Q03468 1493 aa41.59■■■■■ 4.25
RAD51-204ENST00000525066 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.51■■■■■ 4.24
RAD51-204ENST00000525066 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
RAD51-204ENST00000525066 CFTRP13569 1480 aa41.4■■■■■ 4.22
RAD51-204ENST00000525066 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.39■■■■■ 4.22
RAD51-204ENST00000525066 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.35■■■■■ 4.21
RAD51-204ENST00000525066 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
RAD51-204ENST00000525066 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.16■■■■■ 4.18
RAD51-204ENST00000525066 CUX2O14529 1486 aa41.11■■■■■ 4.17
RAD51-204ENST00000525066 PRDM2Q13029 1718 aa41.09■■■■■ 4.17
RAD51-204ENST00000525066 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.09■■■■■ 4.17
RAD51-204ENST00000525066 MRC2Q9UBG0 1479 aa41■■■■■ 4.15
RAD51-204ENST00000525066 WDR62O43379 1518 aa40.88■■■■■ 4.14
RAD51-204ENST00000525066 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
RAD51-204ENST00000525066 TOPBP1Q92547 1522 aa40.51■■■■■ 4.08
RAD51-204ENST00000525066 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.46■■■■■ 4.07
RAD51-204ENST00000525066 ABCC8Q09428 1581 aa40.44■■■■■ 4.06
RAD51-204ENST00000525066 CUX1P39880 1505 aa40.27■■■■■ 4.04
RAD51-204ENST00000525066 IFT140Q96RY7 1462 aa40.2■■■■■ 4.03
RAD51-204ENST00000525066 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
RAD51-204ENST00000525066 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.1■■■■■ 4.01
RAD51-204ENST00000525066 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
RAD51-204ENST00000525066 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
RAD51-204ENST00000525066 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.02■■■■■ 4
RAD51-204ENST00000525066 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.01■■■■□ 3.99
RAD51-204ENST00000525066 SOGA1O94964 1423 aa39.98■■■■□ 3.99
RAD51-204ENST00000525066 SYNJ1O43426 1573 aa39.95■■■■□ 3.99
RAD51-204ENST00000525066 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.92■■■■□ 3.98
RAD51-204ENST00000525066 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
RAD51-204ENST00000525066 TOP2BQ02880 1626 aa39.92■■■■□ 3.98
RAD51-204ENST00000525066 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.973e-8■■■■■ 35
RAD51-204ENST00000525066 WDR97A6NE52 1622 aa39.79■■■■□ 3.96
RAD51-204ENST00000525066 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
RAD51-204ENST00000525066 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.72■■■■□ 3.95
RAD51-204ENST00000525066 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.7■■■■□ 3.95
RAD51-204ENST00000525066 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.56■■■■□ 3.92
RAD51-204ENST00000525066 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.54■■■■□ 3.92
RAD51-204ENST00000525066 GRIN2BQ13224 1484 aa39.51■■■■□ 3.92
RAD51-204ENST00000525066 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.48■■■■□ 3.91
RAD51-204ENST00000525066 PBRM1Q86U86 1689 aa39.47■■■■□ 3.91
RAD51-204ENST00000525066 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
RAD51-204ENST00000525066 CHD1O14646 1710 aa39.39■■■■□ 3.9
RAD51-204ENST00000525066 OSCARQ8IYS5 282 aa39.39■■■■□ 3.9
RAD51-204ENST00000525066 FBLN2P98095 1184 aa39.3■■■■□ 3.88
RAD51-204ENST00000525066 SYNJ2O15056 1496 aa39.24■■■■□ 3.87
RAD51-204ENST00000525066 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.21■■■■□ 3.87
RAD51-204ENST00000525066 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
RAD51-204ENST00000525066 ADAMTS12P58397 1594 aa39.17■■■■□ 3.86
RAD51-204ENST00000525066 KIF27Q86VH2 1401 aa39.14■■■■□ 3.86
RAD51-204ENST00000525066 TRIM41Q8WV44 630 aa39.09■■■■□ 3.85
RAD51-204ENST00000525066 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.07■■■■□ 3.85
RAD51-204ENST00000525066 GRIN2AQ12879 1464 aa39.03■■■■□ 3.84
RAD51-204ENST00000525066 IGF1RP08069 1367 aa38.99■■■■□ 3.83
RAD51-204ENST00000525066 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.96■■■■□ 3.83
RAD51-204ENST00000525066 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.9■■■■□ 3.82
RAD51-204ENST00000525066 CUL7Q14999 1698 aa38.87■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 CEP170Q5SW79 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 NUP160Q12769 1436 aa38.85■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 ARHGEF11O15085 1522 aa38.83■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.83■■■■□ 3.81
RAD51-204ENST00000525066 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.75■■■■□ 3.79
RAD51-204ENST00000525066 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.72■■■■□ 3.79
RAD51-204ENST00000525066 SHROOM2Q13796 1616 aa38.55■■■■□ 3.76
RAD51-204ENST00000525066 ARAP1Q96P48 1450 aa38.54■■■■□ 3.76
RAD51-204ENST00000525066 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.53■■■■□ 3.76
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