RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528073.5

GPAA1-210, Transcript of glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPAA1, Length 986 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1-210ENST00000528073 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.85■■■■■ 5.57
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GPAA1-210ENST00000528073 SMARCA2P51531 1590 aa38.61■■■■□ 3.77
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GPAA1-210ENST00000528073 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.4■■■■□ 3.74
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GPAA1-210ENST00000528073 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.12■■■■□ 3.53
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GPAA1-210ENST00000528073 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.07■■■■□ 3.53
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GPAA1-210ENST00000528073 GRIN2BQ13224 1484 aa35.61■■■■□ 3.29
GPAA1-210ENST00000528073 SYNJ1O43426 1573 aa35.61■■■■□ 3.29
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GPAA1-210ENST00000528073 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.57■■■■□ 3.28
GPAA1-210ENST00000528073 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.57■■■■□ 3.28
GPAA1-210ENST00000528073 PBRM1Q86U86 1689 aa35.56■■■■□ 3.28
GPAA1-210ENST00000528073 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.54■■■■□ 3.28
GPAA1-210ENST00000528073 TRIM41Q8WV44 630 aa35.54■■■■□ 3.28
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GPAA1-210ENST00000528073 ADAMTS12P58397 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
GPAA1-210ENST00000528073 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.2■■■■□ 3.23
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GPAA1-210ENST00000528073 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.08■■■■□ 3.21
GPAA1-210ENST00000528073 NUP160Q12769 1436 aa35.05■■■■□ 3.2
GPAA1-210ENST00000528073 CEP170Q5SW79 1584 aa35.04■■■■□ 3.2
GPAA1-210ENST00000528073 KIF27Q86VH2 1401 aa34.89■■■■□ 3.18
GPAA1-210ENST00000528073 SHROOM2Q13796 1616 aa34.88■■■■□ 3.17
GPAA1-210ENST00000528073 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.83■■■■□ 3.17
GPAA1-210ENST00000528073 IGF1RP08069 1367 aa34.81■■■■□ 3.16
GPAA1-210ENST00000528073 CUL7Q14999 1698 aa34.81■■■■□ 3.16
GPAA1-210ENST00000528073 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.76■■■■□ 3.16
GPAA1-210ENST00000528073 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
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