Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP3S2P59780 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AP3S2P59780 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AP3S2P59780 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP3S2P59780 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms