RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.77■■■■■ 5.08
PPARG-202ENST00000309576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.07■■■■■ 4.16
PPARG-202ENST00000309576 ABCC9O60706 1549 aa39.44■■■■□ 3.9
PPARG-202ENST00000309576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
PPARG-202ENST00000309576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.73■■■■□ 3.79
PPARG-202ENST00000309576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.72■■■■□ 3.79
PPARG-202ENST00000309576 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
PPARG-202ENST00000309576 NACADO15069 1562 aa38.45■■■■□ 3.75
PPARG-202ENST00000309576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.25■■■■□ 3.71
PPARG-202ENST00000309576 SCRIBQ14160 1630 aa37.61■■■■□ 3.61
PPARG-202ENST00000309576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.54■■■■□ 3.6
PPARG-202ENST00000309576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.39■■■■□ 3.58
PPARG-202ENST00000309576 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.16■■■■□ 3.54
PPARG-202ENST00000309576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.53
PPARG-202ENST00000309576 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.4■■■■□ 3.42
PPARG-202ENST00000309576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
PPARG-202ENST00000309576 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.09■■■■□ 3.37
PPARG-202ENST00000309576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
PPARG-202ENST00000309576 SMARCA4P51532 1647 aa36.06■■■■□ 3.36
PPARG-202ENST00000309576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
PPARG-202ENST00000309576 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
PPARG-202ENST00000309576 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.73■■■■□ 3.31
PPARG-202ENST00000309576 WIZO95785 1651 aa35.7■■■■□ 3.31
PPARG-202ENST00000309576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.7■■■■□ 3.31
PPARG-202ENST00000309576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.69■■■■□ 3.3
PPARG-202ENST00000309576 SMARCA2P51531 1590 aa35.62■■■■□ 3.29
PPARG-202ENST00000309576 NCAPD3P42695 1498 aa35.54■■■■□ 3.28
PPARG-202ENST00000309576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.52■■■■□ 3.28
PPARG-202ENST00000309576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PPARG-202ENST00000309576 HMGXB3Q12766 1538 aa35.39■■■■□ 3.26
PPARG-202ENST00000309576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
PPARG-202ENST00000309576 CCDC88BA6NC98 1476 aa35■■■■□ 3.19
PPARG-202ENST00000309576 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.55■■■■□ 3.12
PPARG-202ENST00000309576 CFTRP13569 1480 aa34.54■■■■□ 3.12
PPARG-202ENST00000309576 NESP48681 1621 aa34.43■■■■□ 3.1
PPARG-202ENST00000309576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.38■■■■□ 3.09
PPARG-202ENST00000309576 PRDM2Q13029 1718 aa34.18■■■■□ 3.06
PPARG-202ENST00000309576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.14■■■■□ 3.06
PPARG-202ENST00000309576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.13■■■■□ 3.05
PPARG-202ENST00000309576 ABCC8Q09428 1581 aa33.99■■■■□ 3.03
PPARG-202ENST00000309576 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.97■■■■□ 3.03
PPARG-202ENST00000309576 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.96■■■■□ 3.03
PPARG-202ENST00000309576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.95■■■■□ 3.03
PPARG-202ENST00000309576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
PPARG-202ENST00000309576 ERCC6Q03468 1493 aa33.86■■■■□ 3.01
PPARG-202ENST00000309576 CUX1P39880 1505 aa33.79■■■■□ 3
PPARG-202ENST00000309576 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
PPARG-202ENST00000309576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
PPARG-202ENST00000309576 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.74■■■□□ 2.99
PPARG-202ENST00000309576 TRIM41Q8WV44 630 aa33.72■■■□□ 2.99
PPARG-202ENST00000309576 TOP2BQ02880 1626 aa33.7■■■□□ 2.99
PPARG-202ENST00000309576 TOPBP1Q92547 1522 aa33.69■■■□□ 2.98
PPARG-202ENST00000309576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.68■■■□□ 2.98
PPARG-202ENST00000309576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.66■■■□□ 2.98
PPARG-202ENST00000309576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
PPARG-202ENST00000309576 WDR62O43379 1518 aa33.61■■■□□ 2.97
PPARG-202ENST00000309576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.52■■■□□ 2.96
PPARG-202ENST00000309576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PPARG-202ENST00000309576 CUX2O14529 1486 aa33.38■■■□□ 2.93
PPARG-202ENST00000309576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.35■■■□□ 2.93
PPARG-202ENST00000309576 SOGA1O94964 1423 aa33.35■■■□□ 2.93
PPARG-202ENST00000309576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
PPARG-202ENST00000309576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.24■■■□□ 2.91
PPARG-202ENST00000309576 IFT140Q96RY7 1462 aa33.23■■■□□ 2.91
PPARG-202ENST00000309576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.17■■■□□ 2.9
PPARG-202ENST00000309576 WDR97A6NE52 1622 aa33.14■■■□□ 2.9
PPARG-202ENST00000309576 KIF27Q86VH2 1401 aa33.09■■■□□ 2.89
PPARG-202ENST00000309576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
PPARG-202ENST00000309576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
PPARG-202ENST00000309576 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
PPARG-202ENST00000309576 EEA1Q15075 1411 aa33.03■■■□□ 2.88
PPARG-202ENST00000309576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.871e-6■■■■□ 26.2
PPARG-202ENST00000309576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33■■■□□ 2.87
PPARG-202ENST00000309576 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.96■■■□□ 2.87
PPARG-202ENST00000309576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.93■■■□□ 2.86
PPARG-202ENST00000309576 IGF1RP08069 1367 aa32.93■■■□□ 2.86
PPARG-202ENST00000309576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
PPARG-202ENST00000309576 GRIN2BQ13224 1484 aa32.82■■■□□ 2.84
PPARG-202ENST00000309576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.84
PPARG-202ENST00000309576 PBRM1Q86U86 1689 aa32.75■■■□□ 2.83
PPARG-202ENST00000309576 PRXQ9BXM0 1461 aa32.75■■■□□ 2.83
PPARG-202ENST00000309576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.71■■■□□ 2.83
PPARG-202ENST00000309576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.67■■■□□ 2.82
PPARG-202ENST00000309576 CUL7Q14999 1698 aa32.65■■■□□ 2.82
PPARG-202ENST00000309576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 KIF21BO75037 1637 aa32.62■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.61■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 ADAMTS12P58397 1594 aa32.6■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.6■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.59■■■□□ 2.81
PPARG-202ENST00000309576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.54■■■□□ 2.8
PPARG-202ENST00000309576 SYNJ2O15056 1496 aa32.52■■■□□ 2.8
PPARG-202ENST00000309576 GOLGA3Q08378 1498 aa32.52■■■□□ 2.8
PPARG-202ENST00000309576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
PPARG-202ENST00000309576 GRIN2AQ12879 1464 aa32.42■■■□□ 2.78
PPARG-202ENST00000309576 FBLN2P98095 1184 aa32.39■■■□□ 2.78
PPARG-202ENST00000309576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
PPARG-202ENST00000309576 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.32■■■□□ 2.76
PPARG-202ENST00000309576 CHD1O14646 1710 aa32.27■■■□□ 2.76
PPARG-202ENST00000309576 NUP160Q12769 1436 aa32.26■■■□□ 2.76
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