RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613049.4

RGS3-231, Transcript of regulator of G protein signaling 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RGS3, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGS3-231	ENST00000613049	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.6	■■■■■ 4.25
RGS3-231	ENST00000613049	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.14	■■■■□ 3.38
RGS3-231	ENST00000613049	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.02	■■■■□ 3.2
RGS3-231	ENST00000613049	ABCC9	O60706	1549 aa		34.62	■■■■□ 3.13
RGS3-231	ENST00000613049	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.43	■■■■□ 3.1
RGS3-231	ENST00000613049	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.21	■■■■□ 3.07
RGS3-231	ENST00000613049	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.11	■■■■□ 3.05
RGS3-231	ENST00000613049	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RGS3-231	ENST00000613049	NACAD	O15069	1562 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RGS3-231	ENST00000613049	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RGS3-231	ENST00000613049	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RGS3-231	ENST00000613049	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
RGS3-231	ENST00000613049	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RGS3-231	ENST00000613049	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.54	■■■□□ 2.8
RGS3-231	ENST00000613049	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RGS3-231	ENST00000613049	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.77
RGS3-231	ENST00000613049	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.26	■■■□□ 2.76
RGS3-231	ENST00000613049	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RGS3-231	ENST00000613049	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RGS3-231	ENST00000613049	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RGS3-231	ENST00000613049	WIZ	O95785	1651 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RGS3-231	ENST00000613049	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RGS3-231	ENST00000613049	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RGS3-231	ENST00000613049	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RGS3-231	ENST00000613049	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
RGS3-231	ENST00000613049	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RGS3-231	ENST00000613049	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RGS3-231	ENST00000613049	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RGS3-231	ENST00000613049	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RGS3-231	ENST00000613049	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RGS3-231	ENST00000613049	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RGS3-231	ENST00000613049	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.01	■■■□□ 2.56
RGS3-231	ENST00000613049	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31	■■■□□ 2.55
RGS3-231	ENST00000613049	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.99	■■■□□ 2.55
RGS3-231	ENST00000613049	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.68	■■■□□ 2.5
RGS3-231	ENST00000613049	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.5	■■■□□ 2.47
RGS3-231	ENST00000613049	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.49	■■■□□ 2.47
RGS3-231	ENST00000613049	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.42	■■■□□ 2.46
RGS3-231	ENST00000613049	CFTR	P13569	1480 aa		30.39	■■■□□ 2.46
RGS3-231	ENST00000613049	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.33	■■■□□ 2.45
RGS3-231	ENST00000613049	EEA1	Q15075	1411 aa		30.26	■■■□□ 2.43
RGS3-231	ENST00000613049	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.25	■■■□□ 2.43
RGS3-231	ENST00000613049	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.23	■■■□□ 2.43
RGS3-231	ENST00000613049	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.2	■■■□□ 2.43
RGS3-231	ENST00000613049	SOGA1	O94964	1423 aa		30.18	■■■□□ 2.42
RGS3-231	ENST00000613049	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.16	■■■□□ 2.42
RGS3-231	ENST00000613049	NES	P48681	1621 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RGS3-231	ENST00000613049	CUX1	P39880	1505 aa		30.03	■■■□□ 2.4
RGS3-231	ENST00000613049	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.02	■■■□□ 2.4
RGS3-231	ENST00000613049	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		30.01	■■■□□ 2.39
RGS3-231	ENST00000613049	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.01	■■■□□ 2.39
RGS3-231	ENST00000613049	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.95	■■■□□ 2.38
RGS3-231	ENST00000613049	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.89	■■■□□ 2.38
RGS3-231	ENST00000613049	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.83	■■■□□ 2.37
RGS3-231	ENST00000613049	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.83	■■■□□ 2.37
RGS3-231	ENST00000613049	KIF21B	O75037	1637 aa		29.81	■■■□□ 2.36
RGS3-231	ENST00000613049	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.81	■■■□□ 2.36
RGS3-231	ENST00000613049	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RGS3-231	ENST00000613049	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RGS3-231	ENST00000613049	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.76	■■■□□ 2.36
RGS3-231	ENST00000613049	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.7	■■■□□ 2.35
RGS3-231	ENST00000613049	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.69	■■■□□ 2.34
RGS3-231	ENST00000613049	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RGS3-231	ENST00000613049	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
RGS3-231	ENST00000613049	CEP162	Q5TB80	1403 aa		29.64	■■■□□ 2.34
RGS3-231	ENST00000613049	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.6	■■■□□ 2.33
RGS3-231	ENST00000613049	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.57	■■■□□ 2.32
RGS3-231	ENST00000613049	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.57	■■■□□ 2.32
RGS3-231	ENST00000613049	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.56	■■■□□ 2.32
RGS3-231	ENST00000613049	CUX2	O14529	1486 aa		29.54	■■■□□ 2.32
RGS3-231	ENST00000613049	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
RGS3-231	ENST00000613049	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
RGS3-231	ENST00000613049	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.48	■■■□□ 2.31
RGS3-231	ENST00000613049	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		29.46	■■■□□ 2.31
RGS3-231	ENST00000613049	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
RGS3-231	ENST00000613049	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.42	■■■□□ 2.3
RGS3-231	ENST00000613049	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RGS3-231	ENST00000613049	IGF1R	P08069	1367 aa		29.38	■■■□□ 2.29
RGS3-231	ENST00000613049	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.36	■■■□□ 2.29
RGS3-231	ENST00000613049	CLIP1	P30622	1438 aa		29.35	■■■□□ 2.29
RGS3-231	ENST00000613049	WDR62	O43379	1518 aa		29.33	■■■□□ 2.29
RGS3-231	ENST00000613049	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.29	■■■□□ 2.28
RGS3-231	ENST00000613049	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.25	■■■□□ 2.27
RGS3-231	ENST00000613049	CUL7	Q14999	1698 aa		29.16	■■■□□ 2.26
RGS3-231	ENST00000613049	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.15	■■■□□ 2.26
RGS3-231	ENST00000613049	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		29.14	■■■□□ 2.26
RGS3-231	ENST00000613049	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
RGS3-231	ENST00000613049	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RGS3-231	ENST00000613049	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
RGS3-231	ENST00000613049	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RGS3-231	ENST00000613049	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RGS3-231	ENST00000613049	ARAP1	Q96P48	1450 aa		29.01	■■■□□ 2.24
RGS3-231	ENST00000613049	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RGS3-231	ENST00000613049	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RGS3-231	ENST00000613049	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RGS3-231	ENST00000613049	HRC	P23327	699 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RGS3-231	ENST00000613049	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RGS3-231	ENST00000613049	APLP2	Q06481	763 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RGS3-231	ENST00000613049	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RGS3-231	ENST00000613049	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.84	■■■□□ 2.21

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