Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AP3S2P59780 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AP3S2P59780 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP3S2P59780 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP3S2P59780 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP3S2P59780 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AP3S2P59780 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3S2P59780 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3S2P59780 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3S2P59780 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3S2P59780 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AP3S2P59780 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP3S2P59780 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3S2P59780 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3S2P59780 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3S2P59780 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3S2P59780 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3S2P59780 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3S2P59780 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3S2P59780 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3S2P59780 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3S2P59780 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3S2P59780 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3S2P59780 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3S2P59780 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3S2P59780 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3S2P59780 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AP3S2P59780 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AP3S2P59780 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AP3S2P59780 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AP3S2P59780 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AP3S2P59780 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AP3S2P59780 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AP3S2P59780 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AP3S2P59780 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AP3S2P59780 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AP3S2P59780 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AP3S2P59780 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AP3S2P59780 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AP3S2P59780 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
AP3S2P59780 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AP3S2P59780 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3S2P59780 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3S2P59780 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3S2P59780 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3S2P59780 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP3S2P59780 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP3S2P59780 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP3S2P59780 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP3S2P59780 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3S2P59780 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP3S2P59780 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP3S2P59780 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3S2P59780 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP3S2P59780 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3S2P59780 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3S2P59780 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3S2P59780 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3S2P59780 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3S2P59780 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3S2P59780 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3S2P59780 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3S2P59780 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP3S2P59780 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP3S2P59780 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3S2P59780 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3S2P59780 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3S2P59780 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3S2P59780 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S2P59780 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3S2P59780 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3S2P59780 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3S2P59780 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP3S2P59780 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP3S2P59780 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3S2P59780 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3S2P59780 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3S2P59780 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP3S2P59780 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms