RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.79■■■■■ 5.4
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.15■■■■■ 4.5
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC9O60706 1549 aa41.6■■■■■ 4.25
TSTA3-201ENST00000425753 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
TSTA3-201ENST00000425753 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.48■■■■■ 4.07
TSTA3-201ENST00000425753 NACADO15069 1562 aa40.45■■■■■ 4.07
TSTA3-201ENST00000425753 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.32■■■■■ 4.04
TSTA3-201ENST00000425753 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.3■■■■■ 4.04
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TSTA3-201ENST00000425753 SCRIBQ14160 1630 aa39.32■■■■□ 3.88
TSTA3-201ENST00000425753 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.11■■■■□ 3.85
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TSTA3-201ENST00000425753 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.9■■■■□ 3.66
TSTA3-201ENST00000425753 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
TSTA3-201ENST00000425753 SMARCA4P51532 1647 aa37.72■■■■□ 3.63
TSTA3-201ENST00000425753 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.69■■■■□ 3.62
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.68■■■■□ 3.62
TSTA3-201ENST00000425753 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.58■■■■□ 3.61
TSTA3-201ENST00000425753 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.43■■■■□ 3.58
TSTA3-201ENST00000425753 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.4■■■■□ 3.58
TSTA3-201ENST00000425753 SMARCA2P51531 1590 aa37.38■■■■□ 3.57
TSTA3-201ENST00000425753 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
TSTA3-201ENST00000425753 NCAPD3P42695 1498 aa37.33■■■■□ 3.57
TSTA3-201ENST00000425753 HMGXB3Q12766 1538 aa37.2■■■■□ 3.55
TSTA3-201ENST00000425753 WIZO95785 1651 aa37.16■■■■□ 3.54
TSTA3-201ENST00000425753 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
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TSTA3-201ENST00000425753 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.39■■■■□ 3.42
TSTA3-201ENST00000425753 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.23■■■■□ 3.39
TSTA3-201ENST00000425753 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.22■■■■□ 3.39
TSTA3-201ENST00000425753 NESP48681 1621 aa36.17■■■■□ 3.38
TSTA3-201ENST00000425753 CFTRP13569 1480 aa36.17■■■■□ 3.38
TSTA3-201ENST00000425753 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.94■■■■□ 3.34
TSTA3-201ENST00000425753 PRDM2Q13029 1718 aa35.87■■■■□ 3.33
TSTA3-201ENST00000425753 ERCC6Q03468 1493 aa35.8■■■■□ 3.32
TSTA3-201ENST00000425753 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.79■■■■□ 3.32
TSTA3-201ENST00000425753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.75■■■■□ 3.31
TSTA3-201ENST00000425753 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.7■■■■□ 3.31
TSTA3-201ENST00000425753 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
TSTA3-201ENST00000425753 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.55■■■■□ 3.28
TSTA3-201ENST00000425753 WDR62O43379 1518 aa35.45■■■■□ 3.27
TSTA3-201ENST00000425753 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC8Q09428 1581 aa35.35■■■■□ 3.25
TSTA3-201ENST00000425753 CUX2O14529 1486 aa35.33■■■■□ 3.25
TSTA3-201ENST00000425753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.31■■■■□ 3.24
TSTA3-201ENST00000425753 TOPBP1Q92547 1522 aa35.29■■■■□ 3.24
TSTA3-201ENST00000425753 CUX1P39880 1505 aa35.23■■■■□ 3.23
TSTA3-201ENST00000425753 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
TSTA3-201ENST00000425753 TOP2BQ02880 1626 aa35.08■■■■□ 3.21
TSTA3-201ENST00000425753 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.08■■■■□ 3.21
TSTA3-201ENST00000425753 SYNJ1O43426 1573 aa35.07■■■■□ 3.2
TSTA3-201ENST00000425753 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TSTA3-201ENST00000425753 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.01■■■■□ 3.2
TSTA3-201ENST00000425753 IFT140Q96RY7 1462 aa34.96■■■■□ 3.19
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TSTA3-201ENST00000425753 SOGA1O94964 1423 aa34.85■■■■□ 3.17
TSTA3-201ENST00000425753 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.83■■■■□ 3.17
TSTA3-201ENST00000425753 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.75■■■■□ 3.15
TSTA3-201ENST00000425753 WDR97A6NE52 1622 aa34.73■■■■□ 3.15
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM41Q8WV44 630 aa34.63■■■■□ 3.13
TSTA3-201ENST00000425753 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
TSTA3-201ENST00000425753 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.61■■■■□ 3.13
TSTA3-201ENST00000425753 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.13
TSTA3-201ENST00000425753 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.56■■■■□ 3.127e-7■■■■■ 34.5
TSTA3-201ENST00000425753 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.55■■■■□ 3.12
TSTA3-201ENST00000425753 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.49■■■■□ 3.11
TSTA3-201ENST00000425753 GRIN2BQ13224 1484 aa34.43■■■■□ 3.1
TSTA3-201ENST00000425753 KIF27Q86VH2 1401 aa34.41■■■■□ 3.1
TSTA3-201ENST00000425753 PBRM1Q86U86 1689 aa34.35■■■■□ 3.09
TSTA3-201ENST00000425753 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.34■■■■□ 3.09
TSTA3-201ENST00000425753 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
TSTA3-201ENST00000425753 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.28■■■■□ 3.08
TSTA3-201ENST00000425753 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.22■■■■□ 3.07
TSTA3-201ENST00000425753 IGF1RP08069 1367 aa34.21■■■■□ 3.07
TSTA3-201ENST00000425753 ADAMTS12P58397 1594 aa34.18■■■■□ 3.06
TSTA3-201ENST00000425753 EEA1Q15075 1411 aa34.16■■■■□ 3.06
TSTA3-201ENST00000425753 SYNJ2O15056 1496 aa34.15■■■■□ 3.06
TSTA3-201ENST00000425753 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.13■■■■□ 3.05
TSTA3-201ENST00000425753 CUL7Q14999 1698 aa34.11■■■■□ 3.05
TSTA3-201ENST00000425753 CHD1O14646 1710 aa34.02■■■■□ 3.04
TSTA3-201ENST00000425753 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34■■■■□ 3.03
TSTA3-201ENST00000425753 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TSTA3-201ENST00000425753 GRIN2AQ12879 1464 aa33.99■■■■□ 3.03
TSTA3-201ENST00000425753 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.95■■■■□ 3.02
TSTA3-201ENST00000425753 PRXQ9BXM0 1461 aa33.95■■■■□ 3.02
TSTA3-201ENST00000425753 FBLN2P98095 1184 aa33.93■■■■□ 3.02
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TSTA3-201ENST00000425753 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.87■■■■□ 3.01
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.86■■■■□ 3.01
TSTA3-201ENST00000425753 NUP160Q12769 1436 aa33.86■■■■□ 3.01
TSTA3-201ENST00000425753 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
TSTA3-201ENST00000425753 CEP170Q5SW79 1584 aa33.79■■■■□ 3
TSTA3-201ENST00000425753 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.76■■■■□ 3
TSTA3-201ENST00000425753 KIF21BO75037 1637 aa33.74■■■□□ 2.99
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.64■■■□□ 2.98
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