Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI8

TLK1, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLK1Q9UKI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TLK1Q9UKI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLK1Q9UKI8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TLK1Q9UKI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLK1Q9UKI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms