Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD1Q9NXG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THUMPD1Q9NXG2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THUMPD1Q9NXG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms