Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM7SF3Q9NS93 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM7SF3Q9NS93 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM7SF3Q9NS93 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms