Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R1

NDST4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST4Q9H3R1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NDST4Q9H3R1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDST4Q9H3R1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDST4Q9H3R1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDST4Q9H3R1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDST4Q9H3R1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDST4Q9H3R1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms