Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-8■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.429e-11■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.479e-11■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.047e-8■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 211.79□□□□□ -0.528e-8■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.884e-9■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 NUDT16L1-205ENST00000590460 709 ntTSL 317.13■□□□□ 0.334e-9■■■■■ 33.5
CSTF2TQ9H0L4 KLF6-203ENST00000461124 764 ntTSL 514.46□□□□□ -0.092e-18■■■■■ 33.4
CSTF2TQ9H0L4 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-18■■■■■ 33.4
CSTF2TQ9H0L4 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-18■■■■■ 33.4
CSTF2TQ9H0L4 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.37e-10■■■■■ 33.4
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 216.59■□□□□ 0.255e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.135e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.35e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.325e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.455e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 27.05□□□□□ -1.285e-10■■■■■ 33.3
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 515.03■□□□□ -03e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 59.41□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-8■■■■■ 33.2
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-202ENST00000346198 667 ntTSL 36.39□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.524e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 318.63■□□□□ 0.574e-12■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-211ENST00000528840 456 ntTSL 210.84□□□□□ -0.674e-12■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-216ENST00000534796 900 ntTSL 310.12□□□□□ -0.794e-12■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-204ENST00000475464 366 ntTSL 39.76□□□□□ -0.854e-12■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 PTP4A2-208ENST00000524384 663 ntTSL 57.83□□□□□ -1.164e-12■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 USP54-206ENST00000433394 600 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 USP54-211ENST00000474929 590 ntTSL 47.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 33.1
CSTF2TQ9H0L4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 DRD4-202ENST00000528733 361 ntTSL 314.7□□□□□ -0.061e-8■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-10■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-10■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 29.77□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 SMARCA1-204ENST00000478420 561 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 33
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 38.43□□□□□ -1.061e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 48.43□□□□□ -1.061e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 58.17□□□□□ -1.11e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27.52□□□□□ -1.211e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.331e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.41e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.41e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.41e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.561e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.731e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.761e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.811e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.821e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.861e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.861e-18■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-7■■■■■ 32.8
CSTF2TQ9H0L4 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 58.06□□□□□ -1.128e-10■■■■■ 32.7
CSTF2TQ9H0L4 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 38.06□□□□□ -1.128e-10■■■■■ 32.7
CSTF2TQ9H0L4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 32.7
CSTF2TQ9H0L4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.568e-9■■■■■ 32.7
CSTF2TQ9H0L4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.877e-23■■■■■ 32.6
CSTF2TQ9H0L4 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.219e-9■■■■■ 32.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.345e-11■■■■■ 32.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.095e-11■■■■■ 32.6
CSTF2TQ9H0L4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.125e-11■■■■■ 32.6
CSTF2TQ9H0L4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 32.5
CSTF2TQ9H0L4 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 32.5
CSTF2TQ9H0L4 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 32.5
CSTF2TQ9H0L4 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 45.7□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 32.5
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-216ENST00000471948 2119 ntTSL 220.02■□□□□ 0.83e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.743e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.883e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-10■■■■■ 32.4
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