Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM7Q9C029 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM7Q9C029 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM7Q9C029 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM7Q9C029 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms