Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLDIP3Q9BY77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLDIP3Q9BY77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLDIP3Q9BY77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLDIP3Q9BY77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms