Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF13CQ96RJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF13CQ96RJ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF13CQ96RJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF13CQ96RJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms