Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC110Q8TBZ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC110Q8TBZ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC110Q8TBZ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms