Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VANGL1Q8TAA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VANGL1Q8TAA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VANGL1Q8TAA9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VANGL1Q8TAA9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VANGL1Q8TAA9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms