Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EHBP1Q8NDI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHBP1Q8NDI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHBP1Q8NDI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EHBP1Q8NDI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EHBP1Q8NDI1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms