Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRN1Q6UXK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRN1Q6UXK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRN1Q6UXK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms