Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPTPQ5TA50 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPTPQ5TA50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CPTPQ5TA50 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPTPQ5TA50 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPTPQ5TA50 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPTPQ5TA50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPTPQ5TA50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.5 ms