Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D4BQ5SQS7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2D4BQ5SQS7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH2D4BQ5SQS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH2D4BQ5SQS7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH2D4BQ5SQS7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms