Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMA1Q12791 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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KCNMA1Q12791 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMA1Q12791 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNMA1Q12791 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNMA1Q12791 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNMA1Q12791 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNMA1Q12791 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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